Макарий родился в городе Кашине, от благочестивых родителей – Василия и Ирины Кожиных. Блаженный от юности возлюбил Господа и пошел в Клобуковский монастырь, где и принял монашество. Потом избрал он близ Кашина пустынное место, называемое Калязино, водворился здесь и построил храм Святой Троицы; служил примером добродетели для братии, которых воспитал для вечной славы.
Преподобный скончался в глубокой старости 17 марта 1483 года, а в 1521 году обретены были честные мощи его, которые и доселе изливают различные чудеса и исцеления.
По смерти святителя Ионы, в 1471 году, на место архипастыря избран был по жребию Феофил, протодиакон и ризничий Отенской пустыни. Трудный путь предстоял святителю в управлении паствы своей. Марфа Посадница и ее приверженцы вооружали народ против Великого князя Иоанна, а монах Пимен, бывший ключник, поселял ненависть к архиепископу. Некоторые из мятежников хотели отдать Новгород под покровительство Литвы; чтобы изменить Великому князю, они готовы были поколебать веру своих праотцев. Напрасно блаженный Феофил убеждал буйных одуматься: «Или не изменяйте православию, или не буду пастырем отступников; иду назад в смиренную келью, откуда извлекли вы меня на позорище мятежа». Омраченный народ не внимал словам пастыря. Война разгорелась; новгородцы несколько раз были разбиты и принуждены были просить пощады. Святой Феофил был их заступником, и многие новгородские бояре ему были обязаны за освобождение свое из темниц московских. Старый порядок Новгорода был уже несогласен с новыми порядками России, понимал это блаженный Феофил, но не хотела этого видеть гордость новгородская.
Новгородцы вошли в сношения с польским королем и снова вспыхнуло возмущение, но ненадолго: Иоанн вошел в Новгород и навсегда умолкло вече. Затем заставили Феофила отказаться от управления епархией и отправили его в Москву. Около трех лет он провел в тесном заключении, потом сильно заболел и явился ему Новгородский епископ Нифонт, почивающий в ближней Антониевой пещере, и напомнил ему обещание его поклониться печерским угодникам. Истомленный Феофил, получив позволение, отправился в Киев и уже приближался к Днепру, когда болезнь его усилилась, и он получил откровение, что не достигнет живым до пещер, но тело его упокоится в них. Так и исполнилось, и мощи святителя Феофила почивают в Феодосиевой пещере.
Блаженный Герман сначала подвизался на реке Выге; здесь при часовне нашел его преподобный Савватий, искавший пустынного безмолвия. Герман указал ему на Соловецкий остров, и в 1429 году они вместе переплыли Белое море, достигли острова и поселились там под Секирной горой. В продолжение шести лет жили они в этом уединении совершенными отшельниками.
По кончине Савватия, Герман на время оставил Соловецкий остров, но потом обрел другого ревнителя безмолвной жизни, по имени Зосима и вместе с ним, в 1436 году, опять поселился на острове. В двух верстах от нынешнего монастыря Зосима поставил себе келью, а на расстоянии полверсты от него находилась хижина Германа, где 50 лет прожил он, подвизаясь усердно в безлюдной пустыне.
Блаженный Герман был любознателен и оставил библиотеку избранных книг и много записок о жизни их с Савватием и Зосимой на Соловецком острове. Исполняя монастырские послушания, он не раз оставлял обитель, не раз путешествовал в Новгород и другие места; на послушании и жизнь свою окончил: Герман, быв послан игуменом Арсением, преемником Зосимы, в Новгород и в обитель преподобного Антония Римлянина, почувствовал близость кончины, исповедался, приобщился Святых Христовых Таин и мирно предал душу свою Господу. Ученики блаженного повезли тело его на Соловецкий остров, но за распутицей принуждены были оставить его на берегу реки Свири у часовни. Только спустя пять лет, в 1484 году, при игумене Исаии решились перевезти гроб преподобного Германа в Соловецкую обитель. Когда посланные открыли гроб, то нашли мощи преподобного Германа нетленными; с честью отвезли их на Соловки и поставили близ алтаря церкви святого Николая, по правую сторону, рядом с мощами святого Савватия.
Ныне мощи преподобного Германа почивают в часовне его имени.
Косьма воспитывался в доме одного боярина, который любил юношу за его кротость и чистоту нрава и обучил его грамоте; но и Косьма в свое время оказал сыновнюю услугу и любовь доброму господину. Боярин сильно занемог и, не находя покоя от томительных страданий, ездил с места на место, но нигде не получал облегчения. Добрый Косьма много утешал своего господина чтением слова Божия. Однажды во время переезда остановились они для отдыха при реке Яхроме, в 40 верстах от Владимира-на-Клязьме. Здесь благоговейный юноша услышал голос, который приказывал ему идти в монахи и устроить на том месте обитель. Пораженный внезапностью Косьма взглянул на дерево, откуда слышался голос, и увидел на нем святую икону Божией Матери. Господин его в тот же час получил исцеление от долговременной болезни и с сего времени еще сильнее полюбил своего воспитанника. Блаженный Косьма не замедлил оставить мир, чтобы отправиться в Киево-Печерскую Лавру. Здесь облекся он в иноческую одежду и предался молитвенному подвигу и святому послушанию. Следуя, однако, воле Богоматери, он через некоторое время возвратился на реку Яхрому и с пособием благотворителей соорудил храм в честь Успения Богоматери. Мало-помалу стали собираться к нему братия, и таким образом устроилась обитель. Преподобный Косьма, в сане игумена, назидал братию словом и делом.
Он кончил дни свои в глубокой старости, 18 февраля 1492 года. При его погребении собралось множество народа, и многие исцеления ознаменовали святость усопшего угодника.
Явившаяся преподобному икона ознаменовалась многими чудесами и находится в том же храме, где почивают мощи преподобного.
Митрофан, святитель Воронежский, быв игуменом Косьмина монастыря, так написал на Евангелии: «Выменено сие Евангелие преподобного отца нашего Косьмы, Яхринского чудотворца при игумене Митрофане». Это Евангелие с надписью поныне сохраняется.