После мученической кончины святого Питирима, епископа Пермского, благоговейный инок Иона избран был освященным собором в пастыря Перми. Время поставления его не определено, но нет сомнения, что избрание его последовало вскоре за кончиной его предшественника, ибо обширная паства его не могла долго оставаться без пастыря. Зыряне утешились, видя, что новый их святитель не уступал Питириму ни в духовном мужестве, ни в гражданской деятельности о благе своего края. Таким образом, ревностный Иона предпринял апостольский подвиг, сопряженный с великими препятствиями, который, однако, увенчался полным успехом: это было обращение в христианство народов в Перми великой, живших по Вишере, Каме, Чусовой и другим рекам. До 1462 года они еще хранили заветы глубокой старины, держались многобожия, боготворили духов тьмы и поклонялись бездушным идолам. Соболезнуя о сих несчастных братьях зырянах, Иона обрек себя на служение им и сделался их просветителем.
Вначале, подобно Стефану, он долго боролся с предрассудками закоренелых язычников, переносил обиды и лишения и терпел гонения Христа ради, но победив словом истины упорнейших волхвов, крестил наконец одного пермского князя, нарекши его Михаилом; с его помощью просветил всех пермян, сжег кумирницы, истребил идолов, построил церкви вместо бывших капищ, образовал при них училища и перевел к новопросвещенным опытных иереев из Усть-Выми. К сожалению, подробности сего великого христианского дела не записаны современными летописцами, и местные предания не многое сохранили о том потомству; известно только, что много способствовали успеху проповеди монахи Троицкой Печерской пустыни, основанной епископом Исаакием, как ближайшие соседи к главному городу великой Перми – Чердыни. Они и по кончине блаженного Ионы долго еще отправляли обязанности приходских священников и неутомимо трудились на пользу ближних. Таким образом, пределы Пермской епархии широко раздвинулись к юго-востоку.
Когда радостная весть о просвещении великой Перми достигла Москвы, Великий князь и освященный собор возблагодарили Бога за новое приобретение чад Русской Церкви и прославили апостольский подвиг Ионы. Устюжане и новгородцы, прежде всех узнавшие об успехе проповеди святителя, спешили выразить ему любовь свою богатыми дарами. Слава просветителя великой Перми разнеслась по всей земле Русской, ибо он довершил великий подвиг Стефана и мучеников Герасима и Питирима. Великий князь Иоанн, сын Василия Темного, принял под свою высокую руку великую Пермь вскоре после просвещения, вписав ее в свой царский титул; и таким образом проповедь святителя приобрела новую область России.
Святитель Иона Пермский вместе с прочими епископами писал в 1459 году увещание к литовским епископам сохранять верность Православию и не поддаваться ни обещаниям, ни угрозам папы и его приверженцев.
Последний год своей жизни святитель Иона посвятил на устройство благочиния церковного в своей пастве; им основаны были новые обители, приходы и церкви и умножен клир церковный.
Посреди неутомимых забот о благе церкви скончался блаженный архипастырь 16 июня 1462 года; положено было святое тело его на Усть-Выми, в церкви, по левую сторону Герасима и Питирима – епископов, Усть-Вымских чудотворцев, с надгробными псалмопениями, где и доныне все трое почивают, творят знамения и различные подают исцеления с верой прибегающим к ним, во славу Христа Бога нашего.
Преподобный Варлаам, иже на Ваге, в мире именовался Василий Степанович Своеземцев и был степенным посадником в Новгороде. Он пользовался уважением Великого князя Василия Васильевича, и в договорных грамотах Новгорода с Великим князем имя его написано вместе с именами полномочных Новгорода.
Получив от родителей богатое наследство, он владел таким огромным пространством земель, что река Вага со всеми ее окрестностями была во владении его. Он первый заботился о распространении хлебопашества на Ваге – до того времени чудь питалась ловлей зверей и рыбы – и употреблял свои огромные средства для пользы дикой страны, и особенно старался распространить в народе свет истинного просвещения. В Новгороде он начальствовал честно, ненавидел все худое, и всегда помня заповедь Спасителя, питал сирот, лечил больных и успокаивал странников в своем доме. Много построил он храмов и однажды, услышав чудесный звон колокольный, соорудил на этом месте монастырь во имя Иоанна Богослова, отчего и обитель называлась Богословской. Она устроена при речке Пинежке, впадающей в реку Вагу, неподалеку от основанного им городка Пинежского. Особенно на любимой Ваге он расточал благотворения, и несмотря на то, ему приходилось иногда браться за оружие, чтобы усмирить дикарей, нападавших на его селения. Однажды остяки и вогуличи напали обманом на самого Василия Степановича и его отважную дружину, перебили у него много людей, и сам он с сыном Симеоном и некоторыми воинами едва спаслись бегством.
Наконец он оставил бурный Новгород, по личному опыту изведав, что слава и блага этого мира только суета и тревоги, приготовившись к иноческим подвигам самоотречения делами благотворительности, он принял монашество с именем Варлаама в Богословском монастыре и остальное время жизни проводил в служении Богу и исполнении иноческих обязанностей в таком смирении и послушании, как будто он был ниже всех.
Он кончил дни свои в глубокой старости 19 июня 1462 года. Мощи его почивают в бывшей монастырской, а ныне приходской Богословской церкви.