Преподобный Варнава, быв уже иереем города Великого Устюга, пришел на реку Ветлугу Костромской губернии и устроил себе жилище на Красной горе, за сто верст от жилья человеческого. В этом уединении провел он до тридцати лет, подвизаясь в посте и молитвах и питаясь быльем травным. Дикие звери смиренно приходили к старцу, как бы удивляясь жестокому его житию, и не вредили не только самому подвижнику, но и приходящим к нему для назидания из медоточивых его учений.
Так протекла страдальческая жизнь угодника Божия, и только по смерти его устроилась обитель и город Варнавин на том месте, где была слобода монастырская. Он скончался 11 июня 1445 года. В скором времени по кончине его стали истекать различные чудотворения от мощей преподобного, создан был храм во имя Святой Троицы и другой – во имя святителя Николая.
Слух о чудесах преподобного Варнавы достиг царствующего града Москвы. В 1639 году два иерея, пришедшие с Ветлуги, засвидетельствовали перед святейшим патриархом Иоасафом о чудесах преподобного. Один из них, по имени Онисифор, долго страдавший слепотой, пришел по убеждению ветлугских иноков в обитель к раке Варнавы и тут же получил исцеление. Другой, именем Иоанн, также получил исцеление при раке преподобного. Тогда святейший патриарх послал игумена Железноводского монастыря Пафнутия произвести исследование о двух иереях и о других чудотворениях. Оказалось на месте множество исцелений, о чем Пафнутий донес патриарху, который установил праздновать память новоявленного чудотворца 11 июня.
В бедной, малоизвестной обители Клопской, в 15 верстах от Новгорода, при игумене Феодосии однажды, в летнее время, шла утреня: иеромонах Макарий, совершая каждение во время девятой песни канона, подошел покадить и келью свою, стоявшую близ храма. Но в келье, которая была заперта, он увидел сидящего человека в черном одеянии, который при свече писал книгу Деяний Апостольских. Испуганный Макарий сказал о том игумену, – игумен и братия, после утрени, найдя келью запертой изнутри, разломали двери и увидели пишущего. На вопросы игумена: кто он такой? как его зовут? незнакомец отвечал только повторением предлагавшихся вопросов и выставлял из себя юродивого. Во время литургии странный пришелец вместе с прочими пел, читал Апостол, а за трапезой – житие. Игумен дал ему келью, но никак не мог узнать, откуда и кто он такой. Это было при Великом князе Василии Димитриевиче и при митрополите Фотии. Блаженный поселился в обители в 1408 году. Раз в неделю он вкушал хлеб и пил немного воды, в келье его не было ничего, даже и рогожки – он спал на голом полу. В Клопскую обитель явился он уже иноком и проводил до гроба все ту же суровую жизнь. В праздник Преображения Господня посетил Клопскую обитель князь Константин Димитриевич, сын Донского, лишенный своего удела Великим князем Василием. Он приобщился Святых Таин, был за трапезой, во время которой игумен велел читать блаженному пришельцу. Князь, услышав чтеца и всмотревшись в него, признал в нем ближайшего своего родственника Михаила Максимовича, без вести пропавшего. С этого времени стал Михаил еще более юродствовать, чтобы отречением от благ земных приобрести блага небесные. Благодать Божия возрастала в душе его и по временам проявлялась видимо для всех.
Когда умер архиепископ Иоанн, Михаил сказал игумену Феодосию: «Сидеть тебе во владычнем дому, но стола владычного не удостоишься». И действительно, новгородцы избрали Феодосия в архиепископа после блаженного Симеона и ввели его в дом владычный для управления делами, где он пробыл два года, но те же новгородцы выслали его из владычнего двора.
В 1419 году князь Константин опять прибыл в обитель. «Помолись за меня, – сказал он блаженному, – я очень огорчен потерей отеческого наследства». «Не скорби, князь, – отвечал Михаил, – верь Святой Троице, построй каменный храм в Ее славу и получишь не только отчину свою, но и небесные кровы, а братья примут тебя с честью». Князь тогда же велел призвать каменщиков, и храм, оконченный в два месяца, освящен был в сентябре 1419 года. В самый день освящения князь объявил блаженному Михаилу и игумену: «Вашими молитвами братья зовут меня в мою отчину».
Случилась сильная засуха, так что пересохли все речки, в том числе и Варяжа, из которой брали воду для обители. Пономарь, ходивший на Варяжу, увидел Михаила пишущим что-то на песке. Извещенный о том игумен прочел следующее: «Чашу спасения прииму, на этом месте явится источник». «Что это значит?» – спросил игумен. Блаженный повторил, что писал. Игумен вместе с блаженным Михаилом стали копать землю, и вдруг полился поток воды, который существует и доныне. Во время голода в новгородской стороне Михаил упросил игумена кормить всех голодных. Братия зароптали на трату для них самих необходимого хлеба, Михаил повел игумена и братию в хлебный амбар, и те с изумлением увидели, что запасы хлеба не умалились. «Гости хотят прийти к нам», – со смехом сказал блаженный однажды, подходя к игумену. По выходе из церкви игумен увидел трех чужих людей. «Позови их в трапезу», – сказал Михаил. Игумен позвал. К ним присоединилось еще тридцать человек с оружием, и все сели за трапезу. Двое из них ничего не ели. «Отчего не едите вы? – сказал Михаил. – Будьте уверены, что дурной замысел ваш не исполнится». Устрашенные словами прозорливца, одни упали без чувств, а прочие поспешили удалиться из обители. Один из заболевших разбойников пожелал быть монахом, но игумен боялся постричь его. По повелению Михаила он был пострижен и вскоре умер.
Раз блаженный Михаил был в Вяжецком монастыре. Неожиданно очутился он на колокольне и звонил во все колокола. «Что это значит?» – спрашивал народ. «Ныне в Москве радость, – говорил, юродствуя, Михаил, – у Великого князя родился сын Тимофей, он же и Иван. Да и какой сын! Он будет грозой для соседей, завладеет Новгородом, изменит его обычаи, отберет у вас золото и совсем покорит своей власти». 22 января 1440 года родился князь Иван Васильевич (Великий), известный железной волей и покоривший Новгород.
Блаженный Михаил свободно обличал слабости и людей сильных. Архиепископу Евфимию брадатому сказал он в глаза: «Дозволяют ли правила пастырю расхищать свое стадо? Для кого ты собираешь?» Евфимий, пораженный обличением, заболел и умер. Князь Дмитрий Шемяка не раз просил блаженного помолиться об успехе дел его. В первый раз Михаил отвечал ему: «Довольно бед натворил ты, если еще примешься за то же, со стыдом воротишься сюда, где гроб ожидает тебя!» В другой раз на просьбу его отвечал: «Слышу, князь, земля простонала три раза и зовет тебя к себе». Все это сбылось над Шемякой, как известно по истории.
Прожив в Клопской обители сорок четыре года, блаженный Михаил скончался 11 января 1452 года. Святое тело его положено было в Троицком храме обители. Живой перед Господом праведник продолжал совершать чудеса по воле Божией. В 1562 году построен был новый храм, и в нем поставлена рака с нетленными мощами чудотворца Михаила Клопского.