Подробности жития блаженного Николы неизвестны. В Псковском кафедральном соборе на гробнице его написано: «Преставился святый, праведный Николай, Псковский чудотворец в лето 7084 (1576), февраля 28 числа».
В 1570 году Грозный царь, подступая ко Пскову, замышлял подобно Новгороду наказать и Псков за мнимую измену. В субботу второй недели Великого поста он ночевал в монастыре на Любатове, близ Пскова, в котором никто не смыкал глаз: готовились к смерти. В полночь раздался благовест и звон церквей. Иоанн услыхал этот голос церкви, призывавшей к молитве Богу людей, им уже предосужденных на пытки, на смерть насильственную, на казнь, позор и муки. Умилилось сердце его, и он сказал воеводам: «Иступите мечи ваши о камень – да престанут убийства». На другой день народ встретил царя с хлебом и солью. Столы с яствами поставлены были перед домами на улицах. Предание сохранило в памяти псковичей, что святой Никола, по обычаю детскому сидя на палочке верхом, скакал около государя, безпрестанно говоря: «Иванушко! Иванушко! Покушай хлеба, соли, а не христианской крови!» Царь приказал его схватить, но блаженный стал невидим. Пораженный этим Иоанн забыл гнев, слушал молебен в соборе, поклонился гробу Всеволода-Гавриила и посетил келью убогого Салоса, который предложил ему в угощенье кусок сырого мяса. «Я христианин и не ем мяса в Великий пост», – сказал ему Иоанн. «Ты пьешь человеческую кровь, забывая не только пост, но и Бога», – отвечал отшельник и грозил ему, предсказывая несчастья, если не престанет от кровопролития и грабежа церквей. Царь, не вняв этим словам, велел в Троицком соборе снять колокол, но в ту же минуту пришли ему сказать, что пал любимый его конь. Благочестивый Никола объявил царю, что если возложит руку хоть на единого жителя богоспасаемого града, то Всевышний поразит его. В ужасе бежал Иоанн из города, дозволив воинам грабить имение только богатых людей и не велел трогать иноков и священников; взял казны монастырские, некоторые иконы, сосуды и книги.
Память блаженного празднуется 28 февраля.
В городе Серпухове, около 1495 года, у священника Василия родился сын Иоанн (по другим летописям Василий же). Благочестивое воспитание сына составляло предмет особой заботливости родителя. Обучение грамоте совершалось чтением книг Священного Писания; образование ума, сердца и развитие памяти достигались изучением наизусть всей Псалтири и Евангелия. Такой образ воспитания отрока Иоанна, при благословении Божием, принес и соответственный ему плод. Не достигнув еще юношеского возраста, Иоанн был захвачен и уведен в плен крымскими татарами. Обстоятельство это относят к 1512 году, ко времени набега сыновей Менгли-Гирея.
Воспитанный в Законе Божием отрок не пал в уныние и печаль, а подклонившись твердой верой под крепкую руку Всеблагого и Всевидящего, он благодарил Его и смиренно призывал на помощь, проливая слезы умиления покаянного. Выученные наизусть псалмы Давидовы были ему великим утешением. Молитва в безмолвном уединении мало-помалу стала разливаться тишиной, а потом и теплотой сердца, и в преданности святой Божией воле отрок всей душой и всеми действиями стал последователем Христовым. При трудных работах раба-пленного, которые он исполнял по заповеди, как бы перед лицом Самого Господа, он не оставлял и подвигов поста, бдения и молитвы; непрестанно призывал имя Господа Иисуса, отражая от себя все искушения.
Самые неверные владетели его удивлялись его разуму, совестливому труду, безропотному покорству, кротости и благонравию и на второй год плена его дали ему некоторую ослабу в работах, которой юноша воспользовался, чтобы основательно изучить татарский язык – и разговорный, и книжный. Неисповедимые Судьбы Божии устрояли прославление Истинного Бога, готовя проповедника Истины для страны неверующей.
Через три года отец его, собрав требуемую сумму, выкупил сына, который, воспользовавшись свободой, всецело приступил к служению Господу и немедленно принял ангельский образ в Московской Андрониевой обители. Известно, что, будучи иеродиаконом, он состоял в клире Тверского архиепископа Акакия, а в 1544 году – игуменом Пешношской обители, где стал известен царю Иоанну, посетившему монастырь и видевшему образ действий игумена, благочиние братии и благоустройство монастыря. Когда собор святителей, в 1555 году, избирал иерархов в новопокоренную Казань, Варсонофий был, по указанию самого царя, назначен туда архимандритом и с благословения святителя Гурия основал в самом Кремле монастырь Преображения Господня, процветавший жизнью иноков, руководимых духовномудрым отцом своим, как о том свидетельствует святитель Гермоген.
Знание татарского языка, высоко-добродетельная жизнь и знание врачебное при безмездном врачевании – много помогали блаженному Варсонофию в деле проповеди Единого Истинного Бога, Господа нашего Иисуса Христа.
В 1567 году Варсонофий был вызван из Казани и рукоположен митрополитом Филиппом в епископа Тверского. И в архиерейских палатах в Твери святитель с трудами доброго пастыря соединял и труды инока-подвижника, благодетельного безмездного врача и утешителя бедствовавшего народа.
Свидетель ужасов, совершившихся в эту годину испытания и скорби, казней, пыток и разнообразнейших убийств, святитель видел, как пострадал Герман, архиепископ Казанский за слово истины, и внутри самой паствы своей видел заключенным в Отрочь монастырь, в виду самых его палат, митрополита Филиппа, мученика за веру и отечество, погибшего насильственной смертью. Удрученный годами, свыше 80-летний старец в 1571 году испросил дозволение удалиться на покой в основанный им в Казани Преображенский монастырь и, приняв схиму, кончил труженическую жизнь свою в 1576 году, 11 апреля.
Тело его предано земле за алтарем монастырской соборной церкви и положено рядом с телом святителя Гурия. Святые мощи обоих святителей одновременно обретены в 1595 году, 4 октября. Обретение это совершилось при копании основания под каменную церковь Преображения Господня, которую приказал соорудить царь Феодор Иоаннович вместо бывшей деревянной. В 1702 году святые мощи святителя Варсонофия перенесены в Благовещенский собор, где и ныне почивают. Память святого празднуется 4 октября.