В первые же сутки после начала Великой Отечественной войны стало ясно, что главный удар немецкие войска наносят на Западном и Юго-Западном стратегических направлениях, а на советскую Арктику приходится один из вспомогательных ударов. Гитлеровцы не ожидали здесь сопротивления и рассчитывали на скорый успех. Советские солдаты вспоминали, что немцы вели себя демонстративно по-хозяйски, например, на глазах у красноармейцев ходили за водой. Однако уже спустя несколько дней враг дорого заплатил за иллюзорные надежды на быструю победу.

Блицкриг в Заполярье провалился. Одна из причин заключалась в том, что у вермахта не было здесь эффекта внезапности, так как немецкое наступление в Заполярье началось через несколько дней после нападения на других участках советской границы.

Немцы настолько были уверены, что им удастся осенью 1941 года взять Мурманск, что даже заранее отпечатали специальные приглашения на банкет по поводу своей победы. Он должен был состояться в мурманской гостинице «Арктика». Эти приглашения были найдены у убитых немцев, безуспешно пытавшихся захватить город.

Головко так описывал события второго дня войны: «Батареи, установленные на полуостровах Рыбачьем и Среднем, вчера произвели первый обстрел вражеского конвоя — транспорта и сторожевого катера под немецко-фашистским флагом, выходивших из Петсамо. В основном вела обстрел батарея П. Ф. Космачёва. Финляндия официально еще не воюет, но ее суда используются гитлеровцами для своих перевозок.

Около шестнадцати часов получена директива, повторяющая предыдущие указания: против Финляндии боевых действий пока не вести. Ясно, что наше правительство хочет удержать Финляндию от войны. Не поздно ли? Данные разведки подтверждают — Финляндия закончила мобилизацию и вот-вот начнет действовать вместе с немецко-фашистскими войсками против нас».

На следующие сутки продолжилась эвакуация семей военнослужащих, первыми вывозили тех, кто был в расположении армейских частей на Рыбачьем и Среднем. К счастью, многие из детей в это время, как обычно, отдыхали на юге и поэтому были вне опасности — немецкие самолеты бомбили не только Полярный и другие селения и базы, но преследовали буксиры и катера. Это не осталось для неприятеля безнаказанным: 25 июня старший лейтенант Б. Ф. Сафонов сбил немецкий бомбардировщик «Хейнкель-111» — один из тех, которые бомбили Полярный и Ваенгу. Вражеский самолет, ударившись о воду, разломился, а его экипаж погиб. Подошедший советский крейсер подобрал плававшие на поверхности резиновую шлюпку, навигационные бомбочки, парашюты, погнутые от удара о воду пулеметы.

После этого случая командующий Северным флотом распорядился снабдить резиновыми шлюпками и аварийными радиостанциями все советские самолеты с колесными шасси, летающие над морем. В дальнейшем это спасло жизнь многим советским летчикам, сбитым в небе Заполярья.