Зимой 1664 года на небе была видна яркая комета, и лондонцы опасались, что она предвещает ужасные события. Страна только начала приходить в себя после правления Кромвеля, уже четыре года, как была восстановлена монархия и правил сын казненного Карла I молодой король Карл II.
Лондон в то время был окружен городской стеной с шестью воротами, а с юга протекала Темза, которую можно было пересечь по Лондонскому мосту. В городе были и особняки высшей знати, и кварталы бедняков. Полностью отсутствовала санитария, сточные воды текли прямо по центру извилистых улочек. Булыжники были скользкими от выброшенного из домов мусора, навоза и помоев; летом на улицах роились полчища мух. Корпорация Сити пыталась убирать часть мусора, – его доставляли за пределы стен и оставляли разлагаться там.
Некоторые из товаров, необходимых Лондону, доставлялись на баржах, но большинство привозилось по дорогам. Тележки, экипажи, всадники и пешеходы толпились около узких ворот. Лондонский мост был перегружен еще больше. Воздух в городе был очень плохой, поскольку работали фабрики, производящие мыло, пивоваренные компании и металлургические заводы, а в 15 тысячах домов топили углем.
За городскими стенами, в пригородах, проживали торговцы и ремесленники, также каждый день приходившие в город на работу или для продажи своих товаров. Правительство пыталось контролировать рост лачуг за городскими стенами, однако ничего не получалось, там жили более четверти миллиона человек.
По некоторым оценкам в 1665 году в Лондоне проживало около 460 тысяч человек. По правилам, когда кто-либо умирал, звонил колокол и приходил «искатель смерти», чтобы осмотреть труп и определить причины смерти. Искатели в большинстве своем были невежественными старухами, которые за плату могли внести в официальные записи искаженную причину смерти. Когда человек умирал от чумы, подкупленный искатель называл иную причину смерти. Это происходило потому, что дома жертв чумы по закону должны были быть закрыты на 40-дневный карантин, причем все члены семьи запирались в доме. Двери такого дома отмечались красным крестом и словами «Господи, помилуй нас», также около дверей ставился караульный.
Великая эпидемия 1665 года стала последней крупной вспышкой бубонной чумы в Великобритании. До этого вспышки наблюдались в 1603 году, когда от болезни умерло 30 тысяч лондонцев, в 1625 году, когда произошло 35 тысяч смертей, и в 1636 году, когда от чумы умерло около 10 тысяч человек.
Считается, что в этот раз в Англию эпидемия пришла из Нидерландов, где вспышки бубонной чумы возникали периодически с 1599 года. Как это часто и бывало, заразу завезли голландские торговые суда, которые перевозили кипы хлопка из Амстердама. При этом все прекрасно знали, что в 1663–1664 годах в Амстердаме была эпидемия, умерли около 50 000 человек.
Когда чума добралась до Англии, то первыми пострадали портовые пригороды Лондона, где жили в основном нищие рабочие в ужасных условиях. Две первые подозрительные смерти были зарегистрированы в декабре 1664 и феврале 1665 годов. Эти случаи не были опознаны как чумные, но «почему-то» за первые четыре месяца 1665 года общая смертность сильно возросла. Несмотря на это к концу апреля официально зарегистрировали в качестве именно чумных только 4 смерти, и первый официально зарегистрированный случай относится только к 12 апреля 1665 года; в то же время общее число смертей в неделю возросло с 290 до 398.
При этом с приходом теплой погоды болезнь по пригородам начала распространяться быстрее и даже проникла в сам город. Среди населения началась паника. 30 апреля чиновник морского ведомства Сэмюэл Пипс записал в своем дневнике: «Большие опасения по поводу болезни, говорят, уже 2 или 3 дома в Сити умерли. Господи, помилуй нас всех!».
10 июня Пипс записал: «Вечером, за ужином, к величайшему своему огорчению, узнал, что чума пришла и в Сити (в городе-то она уже четвертую неделю, но до сего дня – за пределами Сити), и надо же было так случиться, что самой первой ее жертвой стал мой добрый приятель и сосед доктор Бернетт с Фэнчерч-стрит. И то, и другое повергает меня в смятение». Доктор Бернетт добровольно закрыл свой дом на карантин после того, как диагностировал у себя заболевание. Он оставался там 2 месяца, за которые умер его слуга, но сам доктор выжил. Выздоровев, он продолжил работать среди бедных слоев населения, пока не заразился снова и не умер в конце августа того же года.
К июлю 1665 года чума распространилась по Лондону. Король Англии Карл II вместе со своей семьей и свитой уехал в Оксфордшир. Однако олдермен и большинство других представителей городской власти предпочли остаться. Сэр Джон Лоуренс, лорд-мэр Лондона, также решил остаться в городе, подвергнув самого себя карантину с помощью специально построенной витрины из стекла, так что он мог выполнять свои обязанности, не контактируя с людьми. Когда большинство богатых купцов покинули город, торговля остановилась. Несколько священников (включая Архиепископа Кентерберийского и епископа Лондона), врачей и аптекарей также вынуждены были остаться.
Бедняки тоже рады были бы сбежать, но им негде и не на что было бы жить, так что пришлось оставаться дома посреди эпидемии. Мало того, проезжая через городские ворота, каждый должен был предъявить справку о хорошем здоровье, выданную лордом-мэром, получить которую становилось все труднее. Поскольку количество жертв все увеличивалось, то жители окрестных деревень начали возмущаться приезжими из Лондона, поскольку не оставалось мест для размещения беженцев. Беженцы пытались вернуться, но их не допускали в города, и многим приходилось жить на собранное с полей или украденное, так что многие поумирали от жажды или голода.
Если обычная смертность в Лондоне в неделю летом тогда составляла 300 человек, то за последнюю неделю июля произошло 3014 смертей, из которых 2020 умерли от чумы. Специально нанятые люди ездили на телегах по городу, призывая людей: «Выносите ваших мертвых», и увозили груды тел. Власти забеспокоились, что это все может вызвать среди населения панику, и приказали проводить вывоз и захоронение трупов только ночью. Однако и телег уже не хватало для этого дела, и трупы начали складывать вдоль домов. Пришлось разрешить собирать трупы и днем и возобновить рытье братских могил.
Городские власти пытались кое-что сделать для борьбы с эпидемией. Они наняли врачей и организовали тщательное захоронение жертв, однако из-за распространившейся по городу паники люди, боясь заражения, хоронили трупы поспешно. Поскольку причина болезни была неизвестна, то многие считали, что ее переносили животные, и поэтому Лондонская Корпорация приказала убивать кошек и собак. Это резко увеличило число крыс в городе, что усилило чуму. Власти также распорядились, чтобы огонь постоянно горел, и днем и ночью, в надежде, что он очистит воздух. Чтобы отогнать инфекцию, жгли разные вещества, распространяющие сильные запахи, такие как перец, хмель и ладан. Жителей Лондона насильно заставляли курить табак.
По документам установлено, что смертность в Лондоне доходила до 1000 человек в неделю, затем – до 2000 человек в неделю, и уже к сентябрю 1665 года достигла 7000 человек в неделю. К концу осени смертность начала снижаться, так что в феврале 1666 года король и его окружение сочли безопасным возвращение в Лондон.
При этом во время эпидемии торговые контакты с материком не прерывались, так что вспышка чумы перекинулась во Францию, где затихла только следующей зимой.
Сильнее всего пострадал Лондон, но чума отмечалась и в других регионах страны.
Только в конце осени и зимой в столицу стали возвращаться дворяне и другие беглецы. Улицы были запружены повозками, возобновилась торговля. В конце марта 1666 года Лорд-канцлер записал: «…улицы полны народа, Биржа переполнена, люди столь многочисленны, как можно было когда-либо видеть…».
При этом отдельные очаги заболевания проявлялись до сентября 1666 года, но уже значительно более медленными темпами. Большой (Великий) пожар, который случился в Лондоне со 2 по 5 сентября, уничтожил дома в большинстве густонаселенных районов. Примерно в это же время вспышки чумы прекратились, вероятно, вследствие того, что большинство инфицированных блох погибло во время пожара вместе с крысами, которые их переносили.
Современные исследователи считают, что это была эпидемия бубонной чумы, во время которой умерло приблизительно 100 000 человек, 20 % населения Лондона.