Ко всем проволочкам перед отплытием в Трою, у ахейского войска возникла еще одна серьезная проблема — моровая язва, которая поражала и скот, и воинов. Диктис рисует ужасную картину — умерших было так много, что невозможно было организовать достойное погребение. И трупы лежали там, где их застигла смерть. Это бедствие было отнесено на счет Агамемнона, убившего козу в роще Дианы (Артемиды), которая ничем не отличалась от других рощ, а царь не ведал о ее священном статусе.

В других версиях говорится не о моровой язве, а о безветрии, которое мешало флоту ахейцев отправиться под Трою.

Так или иначе, Диану-Артемиду надо было как-то задобрить. Святотатство Агамемнона и необходимость жертвоприношения отражено в традиции вполне однозначно. Но не вполне ясно, почему царю надо было принести в жертву именно свою старшую дочь? У Диктиса смутно упоминается «некая жена, одержимая богом». Но, скорее всего, именно старшая дочь оказалась объектом внимания по той причине, что она была для Агамемнона и Клитемнестры приемной — ребенком Елены от Тесея. Эта версия содержится в нескольких источниках. Клитемнестра — сестра Елены и расположена к ней, а потому и забирает ребенка перед замужеством Елены с Менелаем. Теперь же жертвоприношение было формой мести за бегство Елены с Парисом.

Разумеется, запрос на жертвоприношение связан со святотатцем — он, а не кто-либо другой, должен пострадать и искупить вину. Но Агамемнон решительно отказывается отдать в жертву приемную дочь Ифигению. Диктис считает, что за это ахейцы отказываются воздавать ему царствие почести и ставят во главе войска Паламеда, Диомеда, Аякса и Идоменея. Отзвуки этого конфликта угадываются в источниках, но только Диктис пишет о назначении новых командиров взамен Агамемнона. Возможно, это не соответствует действительности: формального отрешения Агамемнона от должности главнокомандующего не было.

Разброд в ахейском войске своей уловкой пытается разрешить Одиссей (откуда у него и слава — одновременно хитроумного и лживого). Он отправляется в Микены с ложным письмом для Клитемнестры, супруги Агамемнона. Будто бы от царя. В письме объявлено о сватовстве Ифигении за Ахилла и сообщено требование прислать ее для бракосочетания. Этот же сюжет упомянут и в «Киприях».

Так Ифигения обманом оказывается в ахейском лагере. Агамемнон готов бросить все и бежать, поскольку не может предотвратить убийства приемной дочери. Только Нестору своими увещеваниями удалось его удержать. Одиссей, Менелай и Калхант уже готовы осуществить заклание молодой девушки, но этому мешает ужасная гроза: божеству такая жертва неугодна. Почему-то всем становится ясно, что Агамемнон пострадает каким-то другим образом — после войны с Троей. То есть, по известной впоследствии трагедии: через убийство Агамемнона собственной женой.

Скорее всего, жертвоприношение было отменено вовсе не потому, что божество сообщило свою волю. Просто лживый замысел Одиссея был раскрыт — Ахилл получил письмо от Клитемнестры с напутствиями будущему зятю. Ахилл останавливает жертвоприношение и отнимает Ифигению у Менелая. Взамен для жертвоприношения у алтаря — откуда ни возьмись — объявляется лань, которую и используют вместо Ифигении. Но опасность для Ифигении от Менелая не исчезает, поэтому Ахилл передает ее скифскому царю. А, надо сказать, скифы (условное название отдаленных народов) у Диктиса то и дело шныряют в прибрежных территориях. Отсюда и последующий сказочный сюжет «Ифигения в Тавриде». Принесена ли она все-таки в жертву или спасена на каком-то торговом или пиратском корабле — сказать наверняка нельзя. Важно, что для последующих веков образовался один из самых излюбленных трагических сюжетов.

Хотя девушка считается спасенной, Агамемнон все же опечален ее потерей. Но тут ему возвращают верховенство в войске. К счастью и моровая язва улеглась (или безветрие прекратилось), и перед отплытием затевается пир всех вождей. После чего войско грузится на корабли и отплывает из Авлиды.

Мы видим, сколь непросты отношение в ахейском войске: здесь, как и в Трое, налицо стратегическая нестабильность, свойственная всему микенскому миру. Подтверждается и шаткость лидерства Агамемнона. А также ахейский обычай приносить человеческие жертвы, которых в Трое не наблюдается.