1 октября 1846 года в селе Селиврия, в восточной Фракии, у Димоса и Василики Кефалас родился пятый ребенок, которому при крещении дали имя Анастасий. Мальчик с детства полюбил храм, Священное Писание, научился молитве. Бедность родителей не позволила учиться на родине, и в 14 лет он уезжает в Константинополь, чтобы поступить на работу и оплачивать учебу.

Жизнь в большом городе была нелегкой — средств не хватало. Понимая, что помощи ждать не от кого, Анастасий решил обратиться с просьбой к Тому, кого так любил и на Чью помощь уповал всю жизнь. Он написал письмо Господу: «Христос мой, у меня нет фартука, нет обуви. Прошу Тебя послать их мне, Ты знаешь, как я люблю Тебя». На конверте написал адрес: «Господу Иисусу Христу на небеса» и попросил отнести письмо на почту своего соседа — торговца. Тот, удивившись необычной подписи на конверте, раскрыл письмо и, увидев такую просьбу и силу веры, отправил мальчику деньги от имени Бога. Так промыслительно Господь не оставлял своего избранника.

Все свое свободное время он посвящал молитве и изучению святых отцов. Его мечтой была проповедь слова Божиего.

Однажды будущий святитель отправился на праздник домой. Корабль, на котором он плыл, попал в шторм. Все пассажиры в ужасе стали роптать на Бога. Анастасий же, ухватившись за провисшие паруса, от всего сердца взывал: «Боже мой, спаси меня. Я буду учить богословие, чтобы заставить замолчать тех, кто хулит Имя Твое Святое». Внезапно шторм прекратился, и корабль благополучно добрался до берега.

В возрасте 22 лет Анастасий переселился на о. Хиос и начал работать школьным учителем. Он создал из учеников прекрасный хор и сам пел с ними в сельской церкви, но душа его тянулась к монашеству.

Анастасий посещал Афон и беседовал со старцами, и в конце концов ушел в монастырь, где принял постриг и сан диакона с именем Нектарий.

Он часто посещал монастырь Неа Мони, а в 1876 году Анастасий становится насельником этого монастыря. 7 ноября 1876 года Анастасий был пострижен в монашество с именем Лазарь. Через три года он удостаивается пострига в мантию и рукоположения во диакона с новым именем Нектарий.

С 1882 года по 1885 год дьякон Нектарий учится на богословском факультете Афинского университета, а после завершения он переезжает в Александрию. Там его приблизил к себе Александрийский патриарх Софроний.

23 марта 1886 года Софроний IV рукополагает дьякона Нектария во священника. Отец Нектарий получает назначение в Свято-Никольский храм г. Каира. В этом же храме вскоре его возводят во епископа Пентапольского, а спустя некоторое время патриарх принимает решение о присвоении ему титула Верховного архимандрита Александрийской церкви.

15 января 1889 года Верховный Архимандрит Нектарий рукополагается во архиерея и назначается митрополитом Пентапольской митрополии. Однако сам отец Нектарий стремился только к достижению смирения. «Сан не возвышает своего обладателя, одна лишь добродетель обладает силой возвышения», — писал он в эти годы.

Однажды ему приснился сон, в котором ему явился святитель Николай Чудотворец. Нектарий в то время восстанавливал в Каире храм в честь этого великого святого. Во сне Нектарий увидел гробницу Николая Чудотворца, а в ней самого Угодника Божия живого, как будто спящего. Затем Николай Чудотворец поднялся из раки и, ласково улыбаясь, просил Нектария украсить ему престол в храме золотом, а затем обнял его и поцеловал. Это, видимо, имело значение особого благоволения к святителю Нектарию.

Однако влиятельные люди патриаршего двора опасались, что отец Нектарий станет претендентом на место Святейшего Патриарха Александрийского, так как Софроний был уже в преклонных летах. Они оклеветали святителя, обвинив не только в посягательстве на патриаршество, но и в аморальной жизни. Митрополит Пентапольский был уволен в отставку и должен был покинуть египетскую землю. Он не пытался оправдываться и защищаться. «Добрая совесть — это самое великое из всех благ. Она — цена душевного мира и сердечного покоя», — говорил в своих проповедях святитель. Слухи опередили его приезд в Афины, его нигде не хотели принимать. Он был лишен не только утешения, но порой и хлеба насущного. Но Господь воздал ему за терпение. Однажды его встретил мэр города и, узнав о его бедственном положении, добился для него места проповедника в провинции Эвбея. Однако и здесь он встретил недоверие и молчаливое осуждение. Отчаявшись, он решил уехать, но буквально за неделю город облетела весть, что слузи о святителе были ложными.

Старца Нектария отличала не только нескончаемая доброта и любовь к людям и всему живому вокруг него, но и необычайная простота. Но до конца жизни он должен был нести крест изгнания и имя опального митрополита, не принадлежащего ни к одной автокефальной Церкви. До конца своих дней митрополит Пентапольский вынужден был находиться в непонятном каноническом положении.

Двенадцать последних лет жизни провел он со своими инокинями, воспитывая их для Небесного Царствия.

Последние месяцы жизни отец Нектарий провел в муках от неизлечимой болезни. Чудеса происходили и в больнице: медсестры заметили, что бинты, которыми обвязывали раны святителя, благоухают. Вместе со святым в палате лежал парализованный человек, и когда душа святого покинула этот мир, то он получил полное исцеление через рубашку святого Нектария.

Старец Нектарий скончался 8 ноября 1920 года. С тех пор много чудесных исцелений произошло у его могилы. 5 ноября 1961 года владыка Нектарий был причислен к лику святых Православной Церкви.