9 октября 1900 года на место отца Авраамия, по благословению отца игумена и старцев, прибыл из монастыря схимонах отец Никифор. Но, пробыв в пустыни всего лишь восемь месяцев, он уехал обратно в монастырь, а на его место 17 мая 1901 года был избран заведовать пустынью Фиваидой иеромонах отец Досифей.

В том году 10 июня трехэтажный корпус и церковь преподобного Тихона Калужского Чудотворца были освящены епископом Досифеем.

Под наблюдением иеромонаха Досифея была проложена новая дорога от морской пристани к скиту и складам и прочная каменная стена с целью остановить обрушение почвы.

На берегу у арсана сделана бухта и крепкая каменная стена от моря на несколько саженей в протяжении к западу для защиты устроенной цистерны.

В этом же 1901 году построена двухэтажная просфорня со следующим распределением помещений: вверху помещены пекарня и две кельи для просфорников, а внизу – две кладовые для муки и дров.

Отец Досифей на время выехал в Россию по требованию Калужского архиерея, и заготовление строительных материалов для предполагаемой постройки собора было остановлено. За время его отсутствия заведование пустынью Фиваида поручено иеросхимонаху духовнику отцу Измарагду, и об этом 28 октября 1901 года старцам и братии Фиваиды было читано постановительное письмо отца игумена Андрея. Возвратился отец Досифей из России только через полгода, то есть 17 апреля 1902 года.