Функция коры надпочечников при гипотиреозе нарушается незначительно, но в связи с замедлением метаболизма гормонов в моче обнаруживают снижение суточной экскреции 17-кетостероидов и 17-оксикортикостероидов.

Нарушение функции половых желез у мужчин проявляется снижением половой потенции, расстройствами сперматогенеза. У женщин гипотиреоз тесно связан с нарушениями менструального цикла (от дисфункции с маточными кровотечениями вплоть до аменореи), снижением либидо, галактореей, гипермастией, бесплодием. Во время беременности у женщины с гипотиреозом имеется высокий риск преждевременных родов или прерывания беременности на различных сроках. В случае вынашивания и рождения ребенка возможно наличие у него нарушений развития нервной системы.