Правильная заготовка и хранение семян оказывают большое влияние на их всхожесть и качество получаемых подвоев.

Семена заготавливают из зрелых плодов, полученных от здоровых и высокоурожайных деревьев. Лучшие семена формируются в плодах, расположенных на периферии кроны. Щуплые семена, а также семена из незрелых, поврежденных болезнями плодов дают сеянцы со слабым ростом.

Семена должны быть полновесными и плотными, с блестящей темной кожурой. Семядоли и зародыш должны иметь белую окраску и не быть стекловидными.

Семена извлекают из плодов, перерабатываемых только холодным способом. Семена из плодов, подвергавшихся варке, непригодны, поскольку температура выше 35 °С оказывает губительное влияние на семена, а при температуре 60 °С они погибают полностью.