Вскоре после смерти Андроника III Палеолога в 1341 г. началась борьба за власть. На трон претендовали два лагеря. Первый возглавил Иоанн Кантакузин – верный друг и соратник умершего императора и сторонник его политического курса. Кантакузин рассчитывал стать регентом при юном наследнике, о чем Андроник III говорил еще в 1330 г., когда полагал, что умирает. Оппозицию Кантакузину составили вдовствующая императрица Анна Савойская, патриарх Иоанн XIV Калека и, к всеобщему изумлению, месазон (высший сановник) императора Алексей Апокавк, который карьерой и состоянием был обязан покровительству Кантакузина. Представители второго лагеря вряд ли имели четкую политическую программу на период регентства. Вероятно, ими руководило лишь стремление сохранить и расширить свое могущество, одновременно отстранив от власти пользовавшегося авторитетом Кантакузина. Быть может, им не давал покоя тревожный пример Михаила VIII, расправившегося с наследником никейского престола Иоанном IV.
Конфликт разгорелся в конце 1341 г., когда регенты объявили о снятии Кантакузина с должности. Он был вынужден укрыться на своей базе во Фракии, в родном городе Дидимотике. Его сторонники и семья были арестованы, мать заключена под стражу, а имущество конфисковано. В ответ присягнувшая Кантакузину армия провозгласила его императором, и началась гражданская война. Регенты позаботились о том, чтобы конфликт воспринимался исключительно как социальное противостояние, как борьба между знатью и менее привилегированными слоями, в числе которых были и богатеющие, но политически бесправные представители среднего класса (месои). Кантакузин заручился широкой поддержкой аристократии, армии и высшего духовенства, а также афонских монастырей благодаря своим связям с архиепископом Григорием Паламой. Горожане, в том числе и месои, приняли сторону Алексея Апокавка.
Оба лагеря приложили немалые усилия, чтобы обострить и без того напряженную ситуацию, что привело к печальным последствиям. В европейских провинциях развернулся театр военных действий: производство сельскохозяйственной продукции существенно снизилось, а войска, снабжаемые соседними государствами, в частности Сербией и османами, в долгосрочной перспективе оказалось очень сложно выдворить. В городах империи царили жестокость и насилие – представители противоборствующих сторон стремились перетянуть на свою сторону как можно больше населения. Большинство провинций поддерживали Кантакузина, однако ситуация в крупных городах выглядела иначе. Там под удар попали аристократы – сначала в Адрианополе, а позже в Фессалониках. Кантакузин был в шаге от захвата Фессалоник в 1342 г., когда там вспыхнул бунт. Его затеяла довольно разношерстная группа, которую составили простолюдины, городские рабочие (в особенности моряки и портовые рабочие) и даже представители аристократии, объединившиеся с целью вытеснить Кантакузина и его сторонников из города. Сын Алексея Апокавка Иоанн стал одним из первых лидеров зилотов, антиаристократического движения, отстаивавшего город вплоть до 1349 г. Зилоты беспощадно убивали аристократов и конфисковывали их имущество; для общих целей, как, например, укрепление города, использовалась даже монастырская или церковная собственность.
Шансы Кантакузина на престол росли, однако король Сербии Стефан Душан продолжал победоносное шествие на юг и был провозглашен царем сербов и греков: он взял под контроль территории от Дуная до Коринфа и от Адриатики до Кавалы, что рядом с Фессалониками; сам город выстоял перед его натиском. Регенты поняли, что возможностей для маневров оставалось все меньше, поэтому предоставили Алексею Апокавку большую свободу действий, хотя недовольство им аристократии усиливалось даже в самом Константинополе. В результате Апокавк пал жертвой царившего в империи насилия: его убили в 1345 г., после чего Кантакузин в начале 1347 г. беспрепятственно вошел в столицу. Несколькими месяцами ранее рухнул восточный полукупол собора Святой Софии – многие расценили это как предзнаменование конца света, город охватил священный ужас. Несколько месяцев спустя в Константинополь пришла Черная смерть. Ее переносчиками стали крысы с генуэзских кораблей, прибывших из Черного моря. Чума бушевала сначала в столице, потом переметнулась в Италию, а затем и в Европу, вызвав всеобщий демографический кризис. В Византию до падения Константинополя чума еще возвращалась более десяти раз.
С воцарением Иоанна VI Кантакузина Григорий Палама, перенесший немало страданий в период регентства, был реабилитирован: Пятый Константинопольский собор, состоявший из шести патриарших совещаний, в том числе в 1347 и в 1351 гг., утвердил богословие исихазма Паламы и осудил его прошлых и нынешних соперников. Палама и его последователи в течение нескольких десятилетий занимали высокие церковные посты. Сам он был назначен архиепископом Фессалоникийским (хотя вплоть до 1350 г. не мог попасть в город, находившийся под контролем зилотов), а некоторые его ученики занимали патриарший престол в Константинополе.
За время своего короткого правления (1347–1354) Кантакузин предпринял попытку построить новый флот, но потерпел неудачу из-за вражды между Венецией и Генуей. Обе упорно защищали свои привилегии, а также коммерческие и политические интересы, особенно возможность выхода к Черному морю, сулившую большую прибыль. В результате Византия находилась меж двух огней. Во время раннего этапа борьбы между городами-монополистами генуэзцы смогли захватить и уничтожить новый флот Кантакузина. Куда больших успехов император добился на Балканах. Во время первых кампаний он вернул часть территорий, завоеванных Душаном (который в это время сражался против венгров на севере), и вытеснил зилотов из Фессалоник.
Хотя Иоанн VI Кантакузин и Иоанн V Палеолог делали шаги к примирению (между Иоанном V и дочерью Кантакузина был заключен брак), напряжение в отношениях соправителей росло. Иоанн Кантакузин уверял молодого императора Иоанна V в полном равноправии, однако в действительности проводил династическую политику, продвигая своих сыновей. В 1349 г. сын Иоанна Кантакузина, Мануил Кантакузин (Асень), был провозглашен деспотом (правителем) Мореи и Мистры. Под его началом город благоденствовал вплоть до 1380 г. Иоанну V достались Фессалоники, но позже он бежал в родной город Дидимотику, который до этого находился под управлением Матфея, старшего сына Кантакузина.
Провозглашение Матфея соправителем Иоанна Кантакузина в 1353 г. заставило Иоанна V начать решительные действия: заручившись поддержкой генуэзцев, он в течение года сумел захватить Константинополь, заставил Иоанна Кантакузина отречься от престола и принять монашеский постриг. Приняв монашество под именем Иоасафа Христодула, бывший император оставался «серым кардиналом» на арене исторических событий вплоть до своей смерти в 1383 г., оказывая политическую и идеологическую поддержку императорам, которые в то время так или иначе приходились ему родственниками. Матфей был вынужден отказаться от имперских притязаний и позже присоединился к своим брату и отцу в Мистре.
Незадолго до переворота, организованного Иоанном V, произошло землетрясение, уничтожившее стратегически значимую крепость Галлиполи. Османы во главе с эмиром Сулейманом, сыном Орхана I и мужем дочери Кантакузина, пересекли пролив и заняли крепость, захватив пленников (самым известным из которых был Григорий Палама). Учреждение османского аванпоста на полуострове Галлиполи традиционно считается первым этапом завоевания Балкан, которое завершилось примерно в течение столетия. Чем сильнее становились османы, тем больше слабела Сербия: со смертью Душана в 1355 г. его обширное государство распалось на многочисленные и враждовавшие между собой разрозненные княжества.
Следующие десятилетия четко обозначили основную угрозу для всех государств Восточного Средиземноморья, будь то греческих, латинских или славянских, – османы никого не щадили. Разрешить ситуацию можно было только дипломатическим путем, поскольку Византия уже не располагала достаточной мощью, чтобы разрешить конфликт силой. Помощь мог оказать лишь Запад, а решение о ее предоставлении принимал Рим. На повестке вновь возник вопрос церковной унии, главной целью которой был крестовый поход против османов, чье продвижение, казалось, уже нельзя было остановить: Дидимотика и Адрианополь (который вскоре стал столицей Османской империи) были захвачены к 1362 г., Пловдив – к 1363 г. Именно тогда был организован очередной, Савойский крестовый поход. Его возглавил Амадей VI Зеленый, граф Савойский (кузен Иоанна V по линии матери), объединив под своим началом венгерские войска и армию Лесбоса (в то время остров находился под контролем генуэзцев), и в 1366 г. отвоевал Галлиполи. В истории это предприятие стало единственной успешной военной кампанией против османов.
В 1369 г. Иоанн V отправился в Рим с особой миссией – руководствуясь личными побуждениями, он признал папскую власть и принял католичество. Византия восприняла это спокойно. На обратном пути в Византию Иоанна задержали в Венеции за долги; чтобы получить разрешение продолжить путь, он был вынужден оставить младшего сына Мануила в качестве почетного заложника. События двух последних десятилетий правления Иоанна разворачивались на фоне непрекращающихся османских завоеваний и семейных раздоров. Уже в 1372–1373 гг. византийский император стал вассалом эмира Мурада I. Для Иоанна V это означало не только необходимость платить немалую дань, но и предоставлять военные силы для поддержки османов в их кампаниях. Андроник IV, старший сын Иоанна, был лишен права наследования престола, поэтому поднял восстание против своего отца в союзе с османским принцем Савджи-беем. Вероятно, Андронику претило совместное правление, поскольку он замещал своего отца на троне, когда тот покидал пределы страны. Восстание было подавлено, Андроник заключен под стражу, а его младший брат Мануил провозглашен соправителем.
В 1376 г. Андроник предпринял еще одну попытку узурпации власти, организовав бунт против отца и младшего брата, и даже захватил Константинополь при поддержке османов, посадив Иоанна и Мануила в тюрьму. В качестве платы за помощь Андроник вернул османам Галлиполи. В 1379 г. Иоанн и Мануил бежали к Мураду и предложили ему более выгодные условия, чем Андроник, в том числе пообещали сдать Филадельфию, последний христианский анклав в Анатолии; позднее Мануил был вынужден принять участие в военной кампании османов и захватить город.
Враждующее семейство пришло к согласию только в 1381 г. Андроник был восстановлен в своих правах на престол как наследник Иоанна V и получил в личную собственность город Селимбрию (Силиври) во Фракии. Мануил завоевал Фессалоники в 1382 г., а также достиг определенных успехов, захватив несколько македонских городов и направив усилия вверенного ему города против нарастающего османского давления. В 1386 г. общины Афона заключили договор с османами, по которому монашество сумело сохранить большую часть своего имущества. Накануне неминуемого захвата Фессалоник в 1387 г. Мануил бежал на Лесбос. После взятия города перед османами открылся путь для дальнейших завоеваний: Болгария стала вассальным государством в 1388 г., а в 1389 г., после тяжелейших потерь с обеих сторон в битве на Косовом поле, эта участь постигла и Сербию.
Тем временем в Мистре на престол вступил Матвей, брат умершего в 1380 г. Михаила Кантакузина. Между Палеологами и Кантакузинами началась борьба за наследство. Победу одержали Палеологи. Они установили свои порядки на Пелопоннесе, возведя на трон Феодора I Палеолога, одного из сыновей Иоанна V, который руководил государством вплоть до своей смерти в 1407 г. В годы его правления продолжалось успешное завоевание полуострова и возвращение земель Морейского деспотата.
Андроник IV умер в 1385 г., а вслед за ним в 1391 г. скончался и его отец Иоанн V. Мануила II Палеолога короновали в большой спешке, опасаясь нового османского правителя Баязида I Молниеносного (1389–1402). Султан хотя и признал смену императора, однако существенно повысил дань и потребовал учредить в городе турецкий квартал с собственным судьей. Тем временем османские завоевания под предводительством Баязида продолжались. В начале 1390-х гг. он захватил Фессалию, Болгария была аннексирована как османская провинция. Турецкие войска стали совершать набеги на Морею. Казалось, теперь Константинополь можно было смело брать, и в 1394 г. султан начал его долгую осаду. Чтобы укрепить свои позиции, он возвел впечатляющую крепость Анадолухисар на азиатском берегу Босфора.
Столица Византии не была готова к долгой осаде. Осознав это, европейские державы обеспокоились всерьез: завоевание Константинополя неизбежно создало бы как политическую, так и экономическую угрозу для Европы – ее торговые интересы оказались бы ущемлены в Леванте, хотя Венеция и Генуя в конце 1380-х гг. уже заключили торговые соглашения с османами. Неудивительно, что антиосманский крестовый поход инициировали правители Венгрии и Валахии – именно те государства, земли которых подверглись бы нападению турок в первую очередь после потери Византии, Болгарии и Сербии. На призыв откликнулись представители бургундской знати во главе с Жаном Неверским (по прозвищу Бесстрашный) и маршалом Жаном II ле Менгром (по прозвищу Бусико), рыцари-госпитальеры, обосновавшиеся на Родосе с 1309 г., а также Венеция.
В 1396 г. внушительная армия крестоносцев столкнулась с войсками Баязида под Никополем на Дунае и потерпела сокрушительное поражение. Венгерский король Сигизмунд I Люксембург бежал в Константинополь, а основная масса бургундцев попала в плен; позднее за них был заплачен огромный выкуп. Большая часть армии крестоносцев была уничтожена. После своего триумфа Баязид продолжил осаду Константинополя. Из столь отчаянного положения Мануил II видел только один выход – заручиться поддержкой Запада. Повторяя опыт своего отца, он собрался лично ехать по дворам Европы, чтобы просить помощи против Османской империи. На время своего отсутствия он поручил город своему племяннику Иоанну VII Палеологу и его соратнику Жану Бусико. Мануил перевез семью в Модон на Пелопоннесе, находившийся под властью венецианцев, а сам отправился на корабле в Венецию в 1400 г., предварительно отправив посольство в Москву в надежде заручиться поддержкой великого князя Московского Василия I Дмитриевича. Мануил провел в путешествиях по Западу более двух лет, посетив Венецию, Падую, Милан, Париж и Лондон. Величественный и несколько экзотичный облик восточного императора и его свиты вызывал всеобщее расположение, западные правители даже обещали помощь, но дальше слов дело не пошло. Показательно, что в своих сношениях с западными правителями Мануил полагался на высокопоставленных рыцарей-госпитальеров, прекрасно понимавших серьезность ситуации благодаря своему пребыванию на Востоке.
Спасение империи неожиданно пришло с Востока, когда могущественный монгольский полководец Тимур (Тамерлан) вступился за туркменские княжества в Анатолии, которые почти покорились Баязиду. В 1402 г. он разгромил османов в битве при Анкаре. Сам султан был пленен, в результате чего Османское государство на десятилетие погрузилось в пучину анархии, пока его сыновья вели ожесточенную междоусобную борьбу за султанский престол, а местные военачальники в Анатолии поднимали восстания против османов.