Вскоре после того, как Кирилл был избран Патриархом Московским и всея Руси, он попытался сделать «Пересвет» основным банком для структур РПЦ — об этом «Медузе» рассказали два источника в церкви. Структуры финансово-хозяйственного управления (ФХУ) РПЦ  владельцем почти контрольного пакета банка — 49,99%. Патриарх после избрания из совета директоров вышел, однако в него входил глава ФХУ РПЦ, викарий патриарха Тихон (Зайцев).

К моменту, когда в банке ввели временную администрацию, ФХУ РПЦ продолжало контролировать 49,7% акций «Пересвета». Тем не менее совет директоров банка представители церкви несколько лет назад покинули. С 2012 года его возглавлял гендиректор «Экспоцентра» Сергей Беднов. «Экспоцентру» по-прежнему принадлежит почти четверть банка; совладелица и замдиректор компании, дочь ректора МГУ Виктора Садовничего Анна Садовничая также в совет директоров «Пересвета».

В 2015 году, уже после того как представители РПЦ покинули совет директоров, «Пересвет» объявил о ребрендинге. В новом логотипе банка, разработанном «Студией Артемия Лебедева», убрали крест со стилизованного купола, а сам купол стал символизировать одновременно купол храма и шлем монаха-богатыря Пересвета, в честь которого назван банк. Впрочем, через два дня после презентации пресс-служба банка , что ребрендинг не состоится, а логотип банка останется прежним.

«Пересвет» пытался использовать авторитет Церкви для решения своих коммерческих задач. В презентации для инвесторов, сделанной перед размещением облигаций банка на Ирландской фондовой бирже, , что «уникальная структура акционеров позволяет банку быть гибким в принятии решений… и объясняет исключительную позицию банка на рынке — это не государственный и не частный банк, а скорее „квазисуверенное“ лицо с определенной нишей клиентов и значительными конкурентными преимуществами». Таким образом, «Пересвет» пытался убедить инвесторов, что является почти госбанком.