Однако, несмотря на свою увлеченность данными, Бертильон допустил серьезную ошибку в самом крупном деле, которым он когда-либо занимался. Он способствовал осуждению Альфреда Дрейфуса по обвинению в государственной измене, предъявив притянутое за уши «геометрическое доказательство»: якобы письмо с предложением о продаже французских военных документов было написано почерком Дрейфуса. Подробное описание бесславного участия Бертильона в деле Дрейфуса можно найти в книге: L. Schneps, C. Colmez. Math on Trial: How Numbers Get Used and Abused in the Courtroom. New York: Basic Books, 2013 («Математика перед судом. Как в зале суда манипулируют и злоупотребляют числами»).