В феврале 1928 года у старца Нектария открылась грыжа, от которой он очень страдал. Он еще ходил, и когда грыжа выпадала, он сам ее вправлял. Но силы его быстро слабели. Он часто ложился отдохнуть. Когда, узнав о его болезни, Надежда Павлович приехала в Холмищи, он принял ее, благословил, но исповедовать не стал: «Я от тебя не отказываюсь. Только грызь у меня. Нет сейчас сил у меня. Ты исповедуйся у другого православного священника. Только в красную, „живую церковь“, не ходи». Н. Павлович пишет в своих воспоминаниях, что он отослал ее из Холмищ домой, сказав: «Я умираю и вымолю тебя у Бога. Я все твое возьму на себя».
Среди последних посетителей старца была его духовная дочь С. А. Энгельгардт (прихожанка храма святителя Николая в Кленниках, в Москве, где настоятелем был священномученик отец Сергий Мечёв, сын праведного Алексия Мечёва, почти всю жизнь прослужившего в этой московской церкви, имевшей постоянную связь с Оптиной пустынью). Вместе с ней были отец Сергий Мечёв, отец Борис Холчев, доктор С. А. Никитин (впоследствии епископ Калужский и Боровский Стефан). Уехали они примерно за неделю до кончины отца Нектария.
Отец Адриан Рымаренко, вызванный телеграммой, приехал в Холмищи в четыре часа пополудни 29 апреля. Матушка Евгения писала: «Батюшка лежал покрытый новой простыней и белым вязаным платком. Отец Адриан с грустью увидел, что батюшка его не узнаёт. Он перешел в приемную и начал читать Псалтирь, которую всегда читали у батюшки. На шестой кафизме отца Адриана позвали к батюшке — помочь его переложить. Были София Александровна Энгельгардт и Мария Ефимовна (монахиня из Гомеля. — М. Л.). Отцу Адриану нужно было подложить руки под спину батюшки, кто-то держал голову. Когда отец Адриан приподнимал батюшку, он так ласково посмотрел на него и что-то прошептал; все видели, что батюшка узнал отца Адриана. Мария Ефимовна принесла два образа из приемной: великомученика Пантелеймона и преподобного Серафима и, указывая на образ целителя Пантелеймона, сказала: „Батюшка, благословите им отца Адриана“. Батюшка с трудом протянул руку, взял образ и положил его на голову отца Адриана. Потом отец Адриан попросил образом преподобного Серафима благословить всю семью нашу. Через несколько минут батюшка погрузился в забытье.
Всех позвали пить чай на половину хозяина (Андрея Ефимовича). Отец Адриан и София Александровна пошли. Вскорости вбегает Мария Ефимовна с криком: „Отец Адриан, идите скорее!“ Отец Адриан бросился к батюшке. Уже обстановка у батюшки была иная: батюшка лежал, повернувшись к стене, покрытый мантией, горели свечи, рядом с кроватью на столике лежала епитрахиль и открытый канон на исход души. Отец Адриан увидел, что батюшка умирает, и начал читать отходную. Прочитал все полностью. Батюшка еще был жив. Отец Адриан, упав на колени, прижался к нему, к его спине под мантией. Батюшка дышал еще некоторое время, но дыхание делалось все реже и реже. Отец Адриан, видя, что батюшка кончается, поднялся с колен и накрыл батюшку епитрахилью; через несколько минут батюшки не стало. Было восемь с половиной часов вечера 29 апреля 1928 года».
Отец Адриан закрыл глаза старцу Нектарию. На другой день к вечеру приехали отец Сергий Мечёв, иеромонах Савва из Звенигородского Саввино-Сторожевского монастыря, отец Андрей Эльбсон из Москвы и отец Петр Петриков из Можайска. Пришел местный священник отец Тихон. Прибыли также и агенты московского ГПУ. Приехавшие из Козельска келейники отца Нектария отец Севастиан и отец Петр облачили батюшку так, как полагается монаху. В ночь на 3 мая из Москвы привезли дубовый гроб-колоду, присланный женой Михаила Чехова. К этому времени собралось немало духовных чад отца Нектария из Москвы, Смоленска, Козельска.
Незадолго до кончины старца спрашивали, где его хоронить в случае кончины. «Старец каждый раз указывал рукой назад, в сторону сельского кладбища», — писала С. А. Энгельгардт. Там и решили хоронить старца. Позднее оказалось, что храм и кладбище в самом селе Холмищи были уничтожены, сельское же сохранилось.
Вынос тела отца Нектария начался в пять часов утра 3 мая. Гроб в холмищенский храм сопровождало очень большое количество народа. Местные власти и московские чекисты следили за всем. Идти было недалеко, но на пути несколько раз совершали литии, и это движение длилось около часу. В Покровской церкви Холмищ совершены были панихида и литургия, — священнослужителей было очень много. Слово произнес отец Тихон. Затем было отпевание и вынос на кладбище, также с литиями па пути. После похорон на могиле в головах утвержден был крест, привезенный из Москвы. Но отцу Петру (Швыреву) не понравилось, что батюшка лежит не лицом ко кресту. Он сделал ночью и поставил другой крест — в ногах покойного. Так и стояло на могиле отца Нектария два креста.
Племянница Андрея Ефимовича Денежкина, хозяина дома, где жил старец Нектарий, вспоминала:
«Мой дядя был зажиточный крестьянин, воспитывал троих детей один. Жениться в третий раз отец Нектарий его не благословил, сказав, что он умрет в поле. Шло раскулачивание, и дядю часто вызывали в сельсовет. Отец Нектарий сказал: „Не бойся, пока я жив, тебя не заберут“. Так это и было. Однажды батюшка спросил: „Что это ты, Ефимыч, строишь в саду?“ — „Баньку. Детки растут, и для тебя удобнее помыться“. — „Ах, ах! Почему ты не взял благословения? Строить надо было вон там, через дорогу, а теперь ни тебе, ни деткам не достанется. И жить им негде будет“. И действительно, после смерти отца Нектария Андрея Ефимовича арестовали, всё забрали, детей выгнали. Незадолго до смерти его (отца Нектария. — М. Л.) хотели взять в Киев, но отец Нектарий отказался и просил похоронить его на общем кладбище». Андрей Ефимович отсидел шесть лет в заключении, потом поехал в Гомель к Марии Ефимовне, там шел пешком по дороге в поле и на пути скончался. Мария Ефимовна услышала по радио объявление о неизвестном, умершем в поле, пошла туда, узнала Андрея Ефимовича и похоронила его.
Другая родственница Андрея Ефимовича вспоминала: «Андрей Ефимович спросил: „Где же тебя, батюшка, похоронить, возле церкви?“ Отец Нектарий просил похоронить его на мирском кладбище, где растут три березки от одного корня (хотя он никогда на кладбище не был). Сказал, что место у церкви будет самое оскверненное. И действительно, в церкви устроили клуб с танцами и музыкой, поставили туалеты, мимо проходили демонстрации с флагами и музыкой».
Близ могилы старца Нектария действительно росли три березы от одного корня. Когда гроб несли на это кладбище, люди клали в него платочки, мотки ниток.
Одна из женщин вспоминала: «Мне было три годика, я очень болела глазами. Веки склеились, выделялся гной и сочилась сукровица. Врачи сказали, что это неизлечимая болезнь — красная волчанка. Мне грозила слепота. Моя крестная, Александра Лаврентьевна, сестра отца, стала протирать мне лицо и глаза платочком с гроба отца Нектария. Глаза очистились, открылись, и по сей день у меня хорошее зрение».
Милиционер из райцентра подъехал к погребальной процессии верхом. Он тронул тело старца палочкой и что-то сказал, насмешливое, недоброе. «Вскоре заболел, его скрючило», — вспоминала свидетельница этого случая.
Л. Нетбальская вспоминала: «Недалеко от могилки отца Нектария был похоронен трагически погибший Николай, студент, сын нашего проводника Н. Е. Кирина (родственника А. Е. Денежкина. — М. Л.). Однажды, приехав к родителям на каникулы, Николай пошел с группой местных парней в лес на охоту. По дороге через кладбище они зашли в оградку могилы отца Нектария. Несомненно по наущению врага рода человеческого Николай снял ружье с плеча и выстрелил в могилку. В то же лето, вынимая это же ружье из коляски мотоцикла, зацепил за курок и был застрелен на глазах у родителей».
Нетление тела старца Нектария впервые было обнаружено в 1935 году. Старец, умирая, сказал А. Е. Денежкину, что через шесть лет они встретятся. «Так и случилось, — писала родственница Андрея Ефимовича. — Через шесть лет дядю освободили из тюрьмы. Узнав, что раскопали могилу отца Нектария, он поспешил на кладбище, где и „встретился“ с отцом Нектарием, как тот предсказал. Раскопали могилу, чтобы взять большой золотой крест, а он оказался медным. Иеромонах Нектарий был как в первый день после смерти: бледный, руки мягкие. Камилавка и воздух (покров на лице) были целые, неистлевшие, только мантия истлела».
Вскоре после 1935 года монахиня Нектария (Концевич) приехала в Холмищи, чтобы посетить могилу старца Нектария. Приехала-то в Козельск, а отсюда она и еще трое женщин отправились в Холмищи к своей цели пешком. Это было в июле. Когда пришли, то увидели, что дома А. Е. Денежкина нет, — он разобран и свезен в другое село. Остановились в другом месте. Был уже вечер, но паломницы все же решили идти на кладбище — версты две или три.
«Мы у дорогой оградки, — пишет матушка. — Непередаваемые словом чувства нахлынули на каждую из нас. Мы, не сговорившись, остановились у оградки, не решаясь войти без благословения. Собрались переночевать тут же, но устали, и ночная свежесть напомнила о благоразумии. Глядя на окружающую природу этого края, сердцем восклицаешь: „Господи, недостойна я видеть земными очами красоту Твоего творения“».
Матушка и еще приходила на кладбище. «Припадешь головой к холму могильному, и не в силах оторваться от земли. Распределишь принесенные цветочки, сядешь на скамейку у холмика, и вся в воспоминаниях, ярких и живых, — вот как будто сам батюшка стоит.
...На кладбище красота неописуемая. Вековые сосны, ели и березы дают много тени и прохлады, сквозь их вершины нежно проглядывает солнышко. Зато поля, окружавшие кладбище, и деревушки, прихотливо прикорнувшие на склонах холмов, ярко залиты летним палящим солнцем, а горизонт окаймлен зеленым бархатом соснового леса. В серенькую погоду весь горизонт застилается сизо-дымчатой пеленой, деревушки глядят сереньким пятнышком».
Здесь упокоился один из великих оптинских старцев, но Божий Промысл о нем был иной. Пришло время, и вновь зазвонили колокола Оптиной пустыни, а вскоре после того обретены были и перенесены в родную обитель цельбоносные святые мощи старца Нектария. Произошло это 3/16 июля 1989 года (в день обретения мощей святителя Филиппа). Когда торжественная процессия шла до территории монастыря, все ощущали дивное благоухание, исходившее от мощей старца. Затем их внесли в Введенский храм и отслужили панихиду о приснопамятном блаженнопочившем старце Нектарии. Рака установлена была в Амвросиевском приделе, где стоит и поныне. Многие из богомольцев, обращавшихся к старцу с молитвой о помощи, получали таковую. О многих молился отец Нектарий при жизни, многим помогал, — Господь слышал его молитвы. Не оставляет он нас и поныне.
26 – 27 июля 1996 года старец Нектарий был прославлен в лике преподобных отцов и старцев, в Оптиной пустыни просиявших.
Преподобный отче Нектарие, моли Бога о нас!