С 2003 года в ранге папского представителя в РФ («апостольский нунций») действует архиепископ Антонио Меннини. А еще в 2002 году Иоанн Павел II принял необдуманное, по мнению РПЦ, решение преобразовать существующие католические структуры (апостольские администратуры) в епархии. Данная инициатива была расценена Московской Патриархией, как попытка католической экспансии и вызвала серьезное напряжение в отношениях.