О юности Иоанна Крестителя не сохранилось почти никаких сведений. Очень вероятно, что семья Иоанна имела связи с ессеями, ибо многое в нём указывает на близкое знакомство с учением и обычаями этой секты. Как и они, Иоанн хранил безбрачие, ждал скорого Суда Божия, был противником фарисеев и саддукеев. Из его слов видно, что он часто размышлял над Книгой пророка Исаии — особенно любимой всеми ессеями. Даже сушёная саранча, которой питался Иоанн, упомянута в ессейских текстах. Само место его проповедей находилось неподалёку от Кумранского монастыря ессеев, располагавшегося на берегу Мёртвого моря. Как символ очищения от грехов он рекомендовал ессейский обряд купания в Иордане. По словам еврейского историка Иосифа Флавия, Иоанн учил иудеев «вести чистый образ жизни, быть справедливыми друг к другу и благоговейными по отношению к Предвечному».

Согласно Евангелию, сутью всех проповедей Иоанна была весть о скором пришествии Христа и о конце света. Он проходил по стране и говорил: «Покайтесь, ибо приблизилось Царствие Небесное, приготовьте путь Господу». Иерусалим, вся Иудея и вся окрестность Иорданская выходили к Иоанну, и многие крестились от него в Иордане, исповедуя свои грехи. Почитатели готовы были видеть в Иоанне самого Мессию. Но он неизменно отвечал им, что является всего лишь Предтечей, посланным возвестить пришествие истинного Христа. «Я крещу вас водою, — говорил Иоанн, — но Идущий за мною сильнее меня; и я не достоин даже того, чтобы развязать ремень на обуви Его; Он будет крестить вас Духом Святым и огнём. Он очистит гумно Своё и соберёт пшеницу Свою, а солому сожжёт огнём неугасимым».

Когда появился Иисус, Иоанн сознательно отступил на второй план и поселился в Еконе близ Салима. В то время Ирод Антипа, правитель Галилеи, отправился по делам в Рим и встретил там своего сводного брата Филиппа, у которого была жена Иродиада. Видя красоту этой женщины, Ирод увлёкся ею и увёз Иродиаду с собой в Иудею, а там женился на ней. Иоанн стал изобличать перед народом его грехи. Он говорил евреям: «Господь запрещает жениться на жене брата своего, потому Ирод должен отослать от себя Иродиаду». Когда слух об этом дошёл до Ирода Антипы, он велел схватить Иоанна и заключить его в темницу. Впрочем, тетрарх не собирался причинять ему зла и даже прислушивался к его советам. Но Иродиада, ненавидевшая Крестителя, думала только о том, как погубить его. Однажды в день своего рождения Ирод дал пир вельможам, тысяченачальникам и старейшинам галилейским. Дочь Иродиады Соломея плясала перед ним и угодила ему. Тогда князь сказал девице: «Проси у меня чего хочешь, и дам тебе всё, даже если попросишь у меня половину царства». Девушка выбежала и спросила у своей матери: «Чего мне попросить?» Та отвечала: «Головы Иоанна Крестителя!» Дочь вернулась к Ироду и попросила: «Хочу, чтобы ты дал мне теперь же на блюде голову Иоанна Крестителя!» Ирод Антипа опечалился, но поскольку не мог уже взять назад своей клятвы, он послал оруженосца в тюрьму и повелел принести голову узника. Оруженосец пошёл, отсёк голову Иоанна мечом в темнице, принёс её на блюде и отдал девице, а та отнесла своей матери. Тело выдали ученикам Иоанна, и те погребли его.