Рюйш занимался анатомией, биологией и ботаникой, составив огромную анатомическую коллекцию, которую купил Петр I, высоко ценивший этого ученого и присутствовавший ил его лекциях. Изобретенный Рюйшем состав, liquor balsamicus, позволил сохранять анатомические препараты и бальзамировать трупы.