• 21 июня – выход «Зари» из Санкт-Петербурга
• 31 июля – судно покинула Александровск-на-Мурмане (ныне – Полярный)
• 13–18 августа – стоянка у Диксона
• 22 августа – «Заря» достигла шхер Минина
• 23 августа – яхта подошла к входу в залив Миддендорфа
• 16 сентября – «Заря» выбирается из ледовой западни в заливе Миддендорфа
• 26 сентября – судно встает на зимовку в бухте Колина Арчера
Выйдя из Санкт-Петербурга, «Заря» направилась в Александровск-на-Мурмане (ныне – Полярный), где на борт взяли двадцать собак, доставленных из Усть-Янска. Вскоре после этого через Югорский Шар яхта вошла в Карское море. Три дня она пробыла у острова Диксон, а затем следовала вдоль берегов Сибири на северо-восток, надеясь достичь Новосибирских островов. Однако уже вскоре после выхода с Диксона на пути встретились значительные массы льда, сильно затруднявшие продвижение судна. Далее, в шхерах Минина, стало еще сложнее. Плавание в неглубоких и совершенно не исследованных проливах среди этих шхер оказалось нелегким, и «Заря» два раза садилась на каменные банки. Следующей вехой путешествия стал залив Миддендорфа, который Толль первоначально принял за Таймырский пролив. Здесь тяжелое состояние льдов более чем на три недели задержало судно, но, даже выбравшись из ледовой западни, продвинуться далеко на восток экспедиции не удалось. «Заря» прошла через пролив между островом Нансена и материком, названный Толлем проливом Фрама, а дальше, в Таймырском проливе, лед оказался еще не взломанным. В итоге «Заря» встает на зимовку в бухте Колина Арчера, названной так в честь строителя нансеновского «Фрама», и остается там до 25 августа 1901 года.