Вносят фосфоритную муку весной или осенью (сначала равномерно рассеивают по участку, затем перекапывают). При этом ее можно смешивать с другими удобрениями, например с сульфатом аммония, аммиачной селитрой, хлористым калием. Нельзя смешивать только с известковыми удобрениями, цианамидом кальция и золой, так как растворимость фосфоритной муки в этом случае уменьшается.

При необходимости известкования почвы фосфоритную муку вносят до этого или через 2–3 года после внесения извести. На очень кислых почвах, например вышедших из-под хвойного леса, перед внесением фосфоритной муки можно вносить известь, но в небольшом количестве – не более 100–200 г молотого известняка на 1 м2.