Для шелковицы характерно многообразие типов половой организации. Растение может быть однодомным, двудомным, иногда и трехдомным. У нее образуются цветки разных типов – женские, мужские, иногда обоеполые, которые могут встречаться на одном и том же дереве или на разных экземплярах во всевозможных комбинациях.

Обычно цветки шелковицы однополые, невзрачные, беловатые; тычиночные – в сережках длиной 1–1,5 см; пестичные – размером несколько миллиметров в диаметре, в маленьких колосовидных соцветиях.

У шелковицы черной рыльца пестиков женских цветков опушенные. У шелковицы белой рыльца пестиков без опушения, но с сосочками, которые эффективно улавливают разносимую ветром пыльцу.

Таким образом, в период цветения, обратив внимание на строение цветков, можно различить виды шелковицы и отличить плодоносящие деревья от мужских растений-опылителей. Деревья с женскими цветками при наличии опылителя дадут обильный урожай.

У шелковицы отмечается также явление партенокарпии, когда плоды образуются без оплодотворения. Изредка у однодомных экземпляров женские и мужские цветки наблюдаются на одном соцветии.