В более слабой или сильной степени черешню поражают следующие болезни: дырчатая пятнистость, бактериальный рак, апоплексия, курчавость листьев, «ведьмина метла», плодовая гниль. На почвах с высоким содержанием извести черешня проявляет признаки хлороза.