Сохранившиеся сочинения Хакуина отражают два подхода к буддийской философии и практике, один — для мирян, другой — для его монахов. В своем обхождении с обычным народом Хакуину весьма успешно удавалось передавать повседневным языком основной смысл Дхармы. Его проповеди и письма содержат смешные истории и простые, но действенные песни и стихотворения. Хотя он не одобрял практику Чистой земли, когда многократно повторяется имя Будды, но как и некоторые дзэнские учители, он охотно побуждал своих последователей среди мирян взывать к Будде посредством повторения его имени и визуализации его образа. Однако он часто напоминал им, что лучше искать Чистую землю в своем сознании, чем молить о перерождении в этом царстве. Хакуин понимал, что практика Чистой земли предназначена для достижения той же цели.

В своих сочинениях Хакуин сетовал на недостаточную жизненность практикующих Сото: «Они практикуют безмолвное, неподвижное сидение, как будто они курильницы в какой-нибудь древней гробнице, и принимают это за настоящую практику великих патриархов».

Хотя прозрения Хакуина не привели к каким-то потрясающим нововведениям, он систематизировал использование коанов, разбив их на уровни, соответствующие различным стадиям развития учеников. Для начинающих он рекомендовал медитировать на коане знаменитого Чжаочжоу:

Медитация на этой беседе позволяет ученикам обдумывать вопрос «Что такое природа будды?» до тех пор, пока они не поймут, что как «обладает», так и «не обладает» являются неверными ответами на этот вопрос!

Хакуину приписывают также несколько собственных известных коанов. Например, он просил своих учеников медитировать на «звучании хлопка одной ладонью».

Как монахов, так и мирян Хакуин учил тому, что для успеха в дзэнской практике важны три вещи: великая вера, великое сомнение и великая решимость. С идеей «великого сомнения» мы сталкиваемся в учениях и других дзэнских учителей, например Бассуя. Хотя некоторые удачливые люди спонтанно переживают состояние неопределенности и с раннего возраста вопрошают, многим для этого нужны годы. Согласно Хакуину, великая решимость, необходимая для занятий строгой практикой коанов, является самым эффективным способом пробуждения сомнения и напряжения, необходимых для прорыва за пределы относительного повседневного сознания. Как говорил Хакуин, «в основе великого сомнения лежит великое пробуждение». В конечном счете, учил он, пробуждение вознаграждает ученика великой радостью, а сомнение предшествует ему: «Оно подобно тому, будто перед вами раскинулась безбрежная пустая бездна, где нет места, куда можно было бы поместить руки и ноги. Вы стоите перед лицом смерти, а в своей груди вы словно ощущаете огонь. Затем внезапно вы чувствуете себя единым с коаном, как тело, так и ум отброшены... затем приходит великая радость». Что же касается веры, то Хакуину было ясно: буддийская практика требует полной приверженности пути, а на это может подвигнуть только великая вера: «Если вы хотите быть в гармонии со своим истинным «я», вы должны быть готовы отпустить его, когда оно повисает над пропастью, и снова вернуться к жизни». Такая вера рождается только от глубокого понимания учения Будды.