В январе 1942 года за убийство 25 000 евреев в латвийской Румбуле он был награжден крестом за военные заслуги с мечами. Ему было присвоено звание генерала ваффен-СС. В апреле 1945 года Еккельн попал в плен к советским войскам. Он был приговорен к смертной казни и повешен в Риге 3 февраля 1946 года.
