Хотя сложность строения тел позвоночных в сравнении с беспозвоночными определенно связана с дупликацией генов, прямой связи между сложностью самих гомеозисных генов и сложностью тела нет. Например, строение тел у некоторых древних позвоночных (рыб) было не таким сложным, как у животных, появившихся позднее (млекопитающих), однако гомеозисных генов у них было немного больше.
