Как выяснилось, Коротков волновался напрасно: Кобулова вызывали в Москву по иному поводу. Решался вопрос о его назначении наркомом НКВД… Узбекистана. Назначение и состоялось вскоре после начала войны. В начале 1945 г. А. Кобулов был назначен первым заместителем начальника ГУПВИ (Главного управления по делам военнопленных и интернированных лиц) МВД СССР. Когда в 1953 г. Л. Берия вновь стал министром МВД СССР, А. Кобулов, уже генерал-лейтенант, был назначен заместителем начальника контрольной инспекции МВД. После ареста Л. Берии в числе его ближайших сотрудников был арестован и А. Кобулов. 26 февраля 1955 г. он был расстрелян.