Книга пророка Софонии состоит из трех глав. Главная тема пророчества – день Господень, то есть суд Божий. Господь через суд над всеми языческими народами и иудеями окончательно уничтожит зло в мире и утвердит Свое блаженное царство. Эта тема раскрывается во всех главах книги.

В 1-й главе пророк, возвестив суд Божий над всем миром (2–3 ст.), открывает преступления иудеев и говорит об их участи в день суда. Из беззаконий иудеев указаны следующие: увлечение культами Ваала, «воинства небесного», Молоха; злоупотребление властью, излишняя роскошь богачей. В конце 1-й главы в кратких, но сильных выражениях описываются действия «дня Господня» (Соф. 1, 14–18).

Во 2-й главе после краткого увещания иудеев обратиться к Господу с покаянием, дабы снискать милость Его до наступления «дня Его гнева», пророк говорит, что день Господень простирается не только на них, но и на весь языческий мир. Далее предвозвещает бедствия дня Господня соседним языческим народам, ближним (филистимлянам, моавитянам, аммонитянам) и дальним (эфиопам, ассирийцам и др.). Особенно картинно изображается запустение столицы Ассирии Ниневии, которая превратится в пустыню и будет логовом для диких животных (Соф. 2, 11–15).

В 3-й главе пророк изображает печальное религиозно-нравственное состояние современного ему Иерусалима, предвозвещает наступление дня Господня (Соф. 3, 1–8), но затем говорит о спасении после суда благочестивого остатка и предсказывает обращение к Богу языческих народов.