Государство до 1966 года являлось британским протекторатом и именовалось Бечуаналенд: основную массу населения здесь представлял народ тсвана, который ранее именовался бечуанами. Но после обретения независимости было принято новое название – уже образованное от названия «тсвана», более актуального.

Голубой цвет на флаге Ботсваны символизирует небо и воду, которой очень не хватает: значительную часть Ботсваны занимает пустыня Калахари. Широкая черная полоса означает чернокожее большинство страны, две белые – национальные меньшинства, а их симметричное расположение – символ гармонии и дружбы.