Несмотря на то что Азербайджан заявляет о себе как о государстве светском, на его флаге присутствуют элементы, ассоциирующиеся с исламом – одной из самых распространенных в мире религий. Ислам исповедует большинство верующего населения государства.

Элементы флага официально истолковываются так: голубой цвет является символом принадлежности к тюркской этноязыковой общности, красный олицетворяет свободу, демократию и стремление к модернизации, зеленый – исламскую веру. Белый полумесяц также является символом ислама, а восьмиконечная звезда – согласно разным трактовкам – означает восемь букв в названии «Азербайджан» (если написать его арабскими буквами; вплоть до начала 1920-х годов в Азербайджане использовалось несколько видоизмененное арабское письмо) или восемь ветвей тюркоязычных народов.