Изменчивость коронавируса

За время распространения по миру коронавирус мутировал (изменился). Исходный тип вируса оказался наиболее распространен в Австралии и США. Ученые назвали его «типом А». Позже он мутировал в «тип В», который и вызвал эпидемию в Китае. У жителей Европы чаще встречается «тип С», который является дочерним от «типа В» (12).

Считалось, что РНК вирусы имеют очень высокую частоту мутаций по-сравнению с ДНК-вирусами, то есть теми вирусами, у которых наследственная информация записана в ДНК. И это, мол, одна из причин того, почему так трудно сделать эффективную вакцину для предотвращения болезней, вызываемых РНК-вирусами. Однако оказалось, что SARS-CoV-2 мутирует в восемь-десять раз медленнее вирусов гриппа. Пока ученые зафиксировали всего 11 изменений на 30 тысяч нуклеотидный пар. Поэтому симптомы и тяжесть протекания заболевания определяются не штаммом вируса, а больше зависят от состоянии здоровья и иммунной системы. Таким образом,"мягкой версии" коронавируса, скорее всего, не существует (13, 14).

Другие ученые выяснили, что с момента вспышки коронавируса в Китае в декабре 2019-го появилось восемь новых штаммов."Вирус мутирует так медленно, что его штаммы очень похожи друг на друга", – сказал профессор кафедры медицины и инфекционных заболеваний Калифорнийского университета в Сан-Франциско Чарльз Чиу.

По данным специалистов, коронавирус мутирует (изменяется) в 8-10 раз медленнее вирусов гриппа (15).

Такую же информацию также озвучила главный санитарный врач РФ А. Попова во время ее интервью Познеру (она там чуть ли не на библии клялась), и эта же информация прозвучала в Италии в официальных пресс-конференциях по поводу коронавируса – мутации в этом вирусе практически не идут. С другой стороны, когда китайские врачи передали несколько десятков штаммов вируса, выделенных за время эпидемии в стране, в них уже было 149 мутаций, но, скорее всего, эти мутации были заменами только одного нулеотида, которые часто не вызывали изменений в строении белков, а если и вызывали то в тех участках полипептидной (белковой) цепочки, которая не важна для функции белка.

Вот все, что пока достоверно (то есть, на базе сведений, опубликованных в научных статьях) известно о самом вирусе. Поскольку сейчас в биологической науке господствуют молекулярные биологи, то большинство таких ученых забыли базовые сведения по гистологии и патанатомии. Поэтому стандартные эксперименты по взаимодействию клеток в пробирке в вирусом и вируса с клетками дыхательных путей почему то не проводятся. А жаль. Наконец, исходя из неких общих закономерностей, считается, что коронавирус ослабнет исходя из общих законов природы, принципов эволюции. Паразит не должен убивать всех своих хозяев (16).

Взаимодействие вируса с клетками

Мои попытки найти научную информацию о том как новый коронавирус взаимодействует с клетками, не дали значительного результата. Корейские ученые обнаружили вирусные частицы SARS-CoV-2 диаметром 70–90 нм в вакуолях, расположенных внутри клеток Vero (это опухолевые клетки) (17). Однако подробного анализа механизмов проникновения, образования транспорта и выделения коронавируса в статье нет. В журнале Наука (Science) приводится схема жизни коронавируса в клетке, высосанная из пальца. Между тем необходимо провести исследование взаимодействию всех известных вирусов с человеческими клетками и ин ситу на животных. Другие базовые вопросы взаимодействия вируса SARS-CoV-2 с клетками практически не изучены от слова совсем. Это свидетельствует, о том, что в клинической вирусологии преобладает грубая эмпирия. Более того, очень мало известно и взаимодействии клеток с другими вирусами, механизмах попадания вирусов в клетки, Это особенно важно, но не изучено для клеток не в культуре ткани, а в органе.

Перечислю эти вопросы.

1. Вирус SARS-CoV-2 попадает в клетку сливаясь с оболочкой клетки или путем эндоцитоза (то есть образования вдавления оболочки клетки внутрь и его последующего отщепления от оболочки; при этом вирус SARS-CoV-2 должен быть внутри образуемого пузырька)?

2. Есть ли рецепторы АСЕ2 на апикальный плазматической мембране эпителиальных клеток человека, а если есть, то на каких клетках и какова их концентрация, как они восстанавливаются после эндоцитоза?

3. В каких клетках его больше?

4. Как вирус взаимодействует с АПМ после приклеивания к рецептору своим зонтиком,

5. Если вирус приникает в клетку путем слияния с плазматической мембраной, то как идет растворение белкового кристалла (капсида), который заключает в себе нуклеиновую кислоту, и как освобождается РНК?

6. Если вирус захватывается клеткой путем эндоцитоза (то есть, образование углубления внутрь цитоплазмы с последующим отщеплением этого углубления с образованием эндоцитозного пузырька или прямой доставки вируса в более крупные вакуоли [эндосомы), то как вирус прорывается через липидную мембрану пузырька/эндосомы в раствор белков цитоплазмы (в цитозоль)?

6. Он синтезирует отрицательную цепь РНК используя свои белки, затем на отрицательной цепи синтезируются копии положительной цепи. На них начинается синтез белков капсида, кристалла, и оболочки. Как?

Как происходит синтез отрицательной РНК, а потом копирование положительной РНК?

7. Синтезирует ли ДНК, которая потом проникает в ядро?

8. Относится ли коронавирус2 к ретровирусам? Скорее всего нет. Есть ли у него обратная репликаза?

9. Как происходит синтез мембранных вирусных белков с трансмембранным доменом и как они транспортируются из эндоплазматического ретикулума, где синтезируюся и как агрегируют другие немембранные белки, образующие зонтикообразные шипы вируса.

Никто не озаботился биологией вируса SARS-CoV-2. ЭМ исследований по вирусу SARS-CoV-2 практически не проводилось. Между тем огромные деньги брошены на создание вакцины, лекарств, но никто не озаботился копеечными экспериментами по взаимодействию вируса и клеток. Без ответа на эти вопросы все эти поиски лекарств, не подтвержденные экспериментами на клетках, не говоря уж о тканях, основная масса денег будет выброшена на ветер, потому что исследователи ищут с закрытыми глазами.

Начну с общих вещей, которые известны о вирусах и которые на основе аналогии могут быть спроецированы на новый коронавирус. Все возможные взаимодействия я буду описывать здесь, исходя из законов дедукции. Если описать все очень и очень упрощенно, то информация такая.