С 1 марта 1947 г. до 4 октября 1948 г. начальником управления 2-Н и заместителем министра госбезопасности Литовской ССР работал бывший начальник УББ МВД Литовской ССР генерал-майор П. М. Капралов. С 4 октября 1948 г. до 20 октября 1951 г. начальником управления 2-Н работал полковник И. Б. Почкай, а с 20 октября 1951 г. до 16 марта 1953 г. – подполковник Т. Н. Жупиков.