Шибайла во время сметоновского режима в Литве являлся активным членом военно-фашистской организации «шаулистов» («стрелков»). В период временной оккупации территории Литовской ССР немецкой армией работал учителем в Укмергском районе. В 1944 г. при отступлении немцев перешел на нелегальное положение и возглавил вооруженные националистические банды на северо-востоке Литвы. Шибайла был одним из организаторов руководящего центра литовского националистического подполья – «Президиума ЛЛКС», в котором возглавлял т. н. «общественную часть», ведавшую вопросами антисоветской агитации и пропаганды, организовывал выпуск подпольных националистических газет и листовок, которые бандитами распространялись среди местного населения.
