С октября 1941 г. Иван Степанович Исаков – на Кавказском фронте как заместитель командующего и член Военного совета Закавказского фронта (с августа 1942 г.) Ему было поручено координировать действия Черноморского флота, Азовской и Каспийской флотилий с операциями фронтов. Это был тяжелый период битвы за Крым и Кавказ. Находясь на передовой и попав под бомбежку у Туапсе, адмирал в октябре 1942 г. получил тяжелое ранение, повлекшее за собой ампутацию левой ноги.
