Если ребенок появляется на свет через естественные родовые пути, его микробиом похож на материнский. Они не идентичны (в связи с тем, что во время родов ребенок получает воздействие и других бактерий, не только материнских), но очень близки друг другу по видовому составу. Это означает, что у ребенка, рожденного вагинально, кишечник заселен теми же видами бактерий, что живут в кишечнике его матери. Или, другими словами, такой ребенок имеет сходные с матерью бактериальные «отпечатки».

Это важный трансгенерационный аспект микобиома человека: бактерии передаются от одного поколения к другому, а затем к следующему и далее. Доктор Домингез Белло называет это наследством по материнской линии.

Если женщина передает свои микробы дочери, рожая ее через естественные родовые пути, то дочь, в свою очередь (если и она будет рожать вагинально), передаст их своим детям. Таким образом, если все женщины рода рожают естественным путем, то новые поколения получают те же бактерии, что жили у их прародительниц по материнской линии вплоть до самых корней семейного древа. Ключом к этому фантастическому процессу наследования служит то, что каждый ребенок проходит по родовому каналу своей матери и взаимодействует с ее влагалищными бактериями, а также контактирует с материнскими фекалиями и заселяет свой кишечник микробами из материнского желудочно-кишечного тракта. Доктор Дитерт рассказывает: «Нам известно, что кишечник малыша во всех деталях отражает материнский кишечник. Микробы передаются от матери следующему поколению, как хромосомы».