Каждое хирургическое вмешательство сопряжено с риском инфекции. Для снижения риска возникновения инфекции обычной практикой стало делать инъекцию антибиотика женщине перед кесаревым сечением. Доктор Мария Глория Домингез Белло раскрывает эту тему в своем исследовании, посвященном влиянию кесарева сечения на микробиом ребенка: «Во время кесарева сечения также применяется антибиотик. Женщина перед операцией получает один грамм пенициллина, и это оказывает влияние на ее микробиоту. Во время родов ребенок получит микробы, которые подверглись воздействию антибиотика».