С 1942 года основной задачей бригады стала подготовка отрядов для действий в тылу противника. К началу осени 1942 года в тыл врага было заброшено 58 таких отрядов. Как правило, выведенная в немецкий тыл разведгруппа становилась ядром для образования партизанского отряда. В конечном итоге многие отряды превратились в крупные партизанские соединения, достаточно уверенно контролировавшие обширные районы в глубоком немецком тылу.

Согласно решению ГКО от 30 мая 1942 года функции по организации партизанского движения были переданы Центральному, республиканским и областным штабам партизанского движения и их представительствам на фронтах и в армиях. После этого основные усилия Четвертого Управления НКВД-НКГБ сосредоточились на организации и руководстве агентурно-разведывательной и диверсионной деятельности в тылу противника. Для этой цели использовались оперативные группы, которые выводились за линию фронта.

Одной из основных их задач был сбор разведывательной информации о войсках противника. И они прекрасно справились с возложенной на них задачей. Например, от 135 оперативных групп Четвертого Управления НКВД-НКГБ СССР (без учета данных, добытых подразделениями республиканского и областного подчинения) поступило 4418 разведывательных сообщений, из них 1358 передано в Главное разведывательное управление Генштаба Красной Армии, 619 командующему авиации дальнего действия, 429 командующим и военным советам фронтов.

Хотя тематика собираемой бойцами оперативных групп сведений не ограничивалась только военными вопросами, напрямую касающимися вермахта. Например, во второй половине 1943 года начальник 2-го отдела Четвертого управления НКГБ подписал два спецсообщения: «О формирование латвийского легиона СС» и «Об активизации литовских националистов».

Также бойцы спецотрядов действовали как высококлассные диверсанты. Например, командующий 2-м Белорусским фронтом Константин Константинович Рокоссовский 24 декабря 1943 года телеграфировал в НКГБ СССР: «Учитывая успешную работу в тылу врага спецотрядов 4-го Управления Вашего Наркомата, действовавших под командованием тт. Каминского, Матвеева, Шихова и оказавших существенную помощь в деле разрушения Увенческого и Гомельского железнодорожных узлов противника, мы просим оказывать дальнейшую помощь Белорусскому фронту посылкой ваших диверсионно-разведывательных отрядов для воздействия на перевозки и разрушения основных железнодорожных коммуникаций в тылу противника».