В конце XIX века при Керченской городской больнице была открыта приходская часовня. Освящена она 5/18 мая 1891 г. во имя святой великомученицы Ирины — небесной покровительницы московской купчихи Ирины Форофонтовой, на средства которой часовня и была сооружена.

В 30-х годах прошлого века часовню закрыли. Она использовалась под различные медицинские учреждения, а позже в ней разместился магазин.

В 1997 году решением Совета Министров Автономной Республики Крым часовня святой великомученицы Ирины была возвращена Русской Православной Церкви.

22 июня 2003 г. в Неделю Всех Святых по благословению Высокопреосвященнейшего Лазаря — митрополита Симферопольского и Крымского в часовне совершена первая Божественная Литургия, что ознаменовало начало новой жизни древней часовни, теперь в качестве полноценного храма.