Зизиулас прошёл полный курс обучения в Экуменическом институте Всемирного совета церквей в Боссэ (Швейцария), затем поступил в аспирантуру Гарвардского университета, где сотрудничал с Обществом византийских исследований и крупнейшим центром американской и мировой византинистики Думабартон-Окс. Он преподавал богословие в Эдинбургском университете, в университете Глазго, в 1989 г. стал постоянным почётным профессором Королевского колледжа Лондонского университета. Преподавал также в Григорианском университете в Риме и Женевском университете, выступал с лекциями во многих университетах Европы. В декабре 2014 г. он заявил, что при папе Франциске он видит основания для быстрого прогресса на пути к достижению полного христианского единства.
