Мюллера не удалось обнаружить после войны. В последний раз его видели в бункере Гитлера в Берлине 29 апреля 1945 года. Некоторые из оставшихся в живых коллег считали, что он состоял на службе у советской госбезопасности, большим почитателем которой он всегда был.
