В ноябре 1944 года Благовещенский руководил идеологической группой Главного управления пропаганды КОНР, одновременно отошел от активной политической жизни. Проводил переговоры с представителями командования армии США о предоставлении убежища членам КОНР. Вероятно, он желал оказаться полезным советской стороне и сам известил ее о своем местонахождении в Мариенбаде (американская зона оккупации). Был выманен «СМЕРШем» и арестован, на закрытом судебном процессе приговорен Военной коллегией Верховного суда СССР к смертной казни и повешен в 1946 году в Бутырской тюрьме.
