Черешня очень требовательна к почвам, она хорошо растет на легких, рыхло-комковатых и воздухопроницаемых почвах, которые имеют подстилку в виде водопроницаемой подпочвы. Оптимальны для нее мощные сероземы, средние суглинки и хорошо удобренные супесчаные почвы. Кислотная реакция должна быть нейтральной. Торфяники и тяжелые глинистые земли не подходят для черешни, поскольку ей нужны хорошо дренированные почвы.
Хотя черешня достаточно влаголюбивая культура, но она не выносит застоя воды, плохо реагирует на близость грунтовых вод, залегающих на глубине 1,5 м от поверхности или еще ближе. Плохо действует на черешню длительный застой (2–3 недели) талых, паводковых вод весной или дождевых вод летом и осенью. Переувлажнение почвы угнетает черешню, поскольку лишняя влага не пропускает кислород к корням. Они начинают задыхаться, из-за чего ослабляется рост, а приросты побегов снижаются до 8—10 см в год. У дерева в возрасте 5–6 лет, растущего на слишком влажной почве, начинает усыхать вершина, далее сохнут мелкие ветви, затем наступает черед уже крупных ветвей. Если вовремя не отвести воду, можно потерять дерево.