Сергей Козлов после окончания с отличием в 1981 году штурманского факультета Ленинградского высшего военно-морского училища имени М. В. Фрунзе до 1998 года (с перерывом на два года учебы в Военно-морской академии) служил на Северном флоте. Прошел путь от инженера электронавигационной группы большой атомной подводной лодки до флагманского штурмана флотилии АПЛ. Участвовал в девяти дальних походах, награжден орденами «За личное мужество» и «За военные заслуги». Был заместителем главного штурмана ВМФ. Вскоре после экспертизы по делу «Курска» Сергей Козлов был назначен главным штурманом ВМФ России и стал контр-адмиралом, впоследствии назначен начальником Управления навигации и океанографии Минобороны РФ — начальником гидрографической службы ВМФ. С июля 2010 года возглавляет ВТУ ГШ и Топографическую службу ВС РФ.
