Родился в 1574 году, после Джона Ди был главным представителем английской эзотерической мысли. На эту тему он написал и опубликовал большое количество работ и развил одну из самых понятных формулировок герметической философии. Как считается, его творчество сравнимо с «секретной печатью или кодом герметической секты». Флудд никогда не признавался официально в своей принадлежности к «розенкрейцерам», бывшим в то время предметом скандала на континенте, но он никогда не скрывал своих симпатий по отношению к ним.

Член Лондонского медицинского колледжа, Флудд имел среди своих друзей Уильяма Харвея, который открыл законы циркуляции крови. Яков I и Карл I подарили ему земли в Суффолке; он также принимал участие в переводе так называемой Библии «от короля Джеймса». Совсем молодым человеком он вошел в эзотерические круги Оксфорда, где он и был воспитан, затем, между 1596 и 1602 годами, в Европе вместе с будущими сторонниками розенкрейцерского движения и Грютером, близким другом Валентина Андреа.

В 1602 году его вызвали в Марсель для выполнения функций наставника самого младшего сына герцога де Гиза, Шарля, с которым Флудд, кажется, оставался до 1620 года. В 1610 Шарль женился на Генриетте-Катерине де Жуайез, которая принесла ему в приданое Куизу, что рядом с Ренн-ле Шато, и Арк, где находится знаменитая могила. После заговора против французского короля герцог де Гиз в 1631 году бежит в Италию; вскоре к нему присоединяется его жена, но когда, овдовев, она просит разрешения вернуться во Францию, король потребовал взамен удовлетворения ее просьбы Куизу и Арк.