В детском возрасте причиной инсульта могут быть: заболевания крови (серповидно-клеточная анемия, тромбоцитопеническая пурпура – болезнь Верльгофа, лейкозы и др.), заболевания сердца (врожденные пороки развития сердца, кардиомиопатии, бактериальный эндокардит), острые инфекционные и вирусные заболевания головного мозга (коревой, герпетический, постгриппозный энцефалит), генетические заболевания, такие как болезнь Мойа-мойа (редкое нарушение, затрагивающее артерии мозга, сопровождаемое их сужением), и другие заболевания.

Во многих случаях инсульт в детском возрасте возникает из-за аномальных врожденных особенностей строения сосудов головного мозга (аплазия магистральных артерий головы и шеи, которые доставляют кровь к головному мозгу; артериально-венозные мальформации, артериальные аневризмы).

С развитием молекулярной генетики большое значение стали придавать врожденным нарушениям в системе свертывания крови, которые могут приводить к избыточной свертываемости крови – гиперкоагуляции и развитию инсульта в детском возрасте.

Считается, что в Европе врожденные коагулопатии (нарушения свертываемости крови) составляют от 10 до 50 % среди всех причин инсульта у больных до 18 лет.

Геморрагический инсульт чаще всего происходит вследствие кровотечения из поврежденных сосудов головного мозга (разрыв артериальной аневризмы внутримозговых сосудов, кровотечение при разрушении стенки воспаленного сосуда при некоторых инфекционных заболеваниях головного мозга). Возможны и другие причины, например нарушения свертывания крови (тромбоцитопеническая пурпура, гемофилия). Разрыв кровеносного сосуда может произойти вследствие черепно-мозговой травмы, при опухолях, при заболеваниях крови.

В клинической практике редко встречается только одна причина. Как правило, имеется несколько предрасполагающих факторов. По разным данным, из-за сложностей в диагностике примерно в половине случаев причину инсульта в детском возрасте часто не удается установить. Причины развития аномалий развития сосудов тоже часто остаются неясными.