Ступенчатая модель эволюции применима к существам наподобие бактерий, большая часть которых не размножается половым путем. В случае животных, размножающихся исключительно половым путем (например, человека), эволюционные изменения обычно не «дожидаются» проявления ключевой мутации (эту ошибку часто совершают критики теории эволюции). Вместо этого у популяции, размножающейся половым путем, есть несколько аллелей на выбор. Естественный отбор чаще смещает баланс в сторону одной из имеющихся аллелей, чем «ждет» проявления ключевых мутаций. В случае бактерий, не размножающихся половым путем, понятие генофонда не вполне применимо. Вот почему здесь, в отличие от птиц, млекопитающих или рыб, мы можем ожидать хорошо различимых ступеней.