Новые бригады каменотесов были брошены на уничтожение имени Атона, так же как раньше они уничтожали имя Амона. Дворец Эхнатона и храмы были разрушены, а его новая столица была покинута навсегда. Археологи имели огромные преимущества при раскопках относительно неповрежденного города, когда начались работы в Тель-эль-Амарне, где располагалась столица Эхнатона.