Святитель родился в деревне Береза Смоленской губернии 1 августа 1836 года в семье дьякона Касаткина и при крещении получил имя Иван. Рано оставшись сиротой, Иван провел детство и юность в лишениях и нужде, но все же смог успешно закончить Петербургскую духовную академию. В 1860 году святитель принял постриг и получил имя Николай.

Николай отправился в Японию, где принял должность настоятеля православной посольской церкви. Несмотря на запрет христианской религии, незнание языка, враждебность японцев и другие трудности, святитель Николай неустанным трудом прокладывал путь православию. К концу жизни он привел к православной вере 33 тысячи японцев.

О даре убеждения Николай говорит, например, такой факт. Однажды ночью в русскую миссию ворвался ронин Савабэ Такума со своими друзьями. Будущий святой равноапостольный отец Николай Японский не только убедил Савабэ, что не представляет опасности для Японии, но и заинтересовал этого ронина Христом. Три года Савабэ прожил в миссии и в 1868 году принял православное крещение и стал зваться Павлом.

В 1880 году Николай принял сан епископа Токийского, в 1906 был возведен в сан архиепископа за свою смиренную жизнь и подвижничество. Святитель мирно отошел в Господу в 1912 году, оплакиваемый собратьями по вере и новообращенными японцами. В Японии Николай почитается как особый молитвенник перед Господом и великий праведник. Он стал третьим русским святителем, прославленным в чине равноапостольного.

Еще один интересный факт о святом. Известно, что он… курил. В его дневниках есть замечательная запись: "Вечером скучно было и хотелось курить, а, между тем, бросил с воскресенья – более чем двадцатилетнюю привычку не легко бросить". Значит, большую часть своей жизни святитель курил. Что не мешало ему быть истинным Христовым апостолом.

К Николаю Японскому обращаются те, кто ищет заступничества перед Богом, кто нуждается в утешении и смирении. День памяти святителя православная церковь отмечает 16 февраля.