Этап управления боевыми механизмами путем нажимания кнопок и переключения рычагов был окончательно пройден после того, как профессор кибернетики Н. Биреко опубликовал свой фундаментальный труд «Нанотехнологии в нейрохирургии», математически обосновывающий возможность создания устройств, воспринимающих биотоки мозга разумного. Спустя несколько лет выдающийся хирург В. Зин после серии из нескольких неудачных экспериментов на добровольцах (по другим данным — на преступниках) осуществил операцию по вживлению в головной мозг живого разумного устройства вывода биотоков. Еще через год успешно завершилась первая операция по вживлению устройств ввода-вывода микротоков. С этого момента принципы управления боевыми механизмами основываются на так называемых «нейронных управляющих сетях». В определенные группы клеток головного мозга вставлены миниатюрные приборы, отвечающие за ввод/вывод электрических импульсов, за счет чего достигается полное слияние разумного с мехом, и управляющие команды подаются непосредственно мозгом пилота без задействования прочих частей организма разумного. После обработки компьютером меха они превращаются в команды для конкретных узлов боевой машины. Именно этим объясняется практически 100 % гуманоидные формы (вертикальное расположение корпуса, две верхние и две нижние конечности) боевых мехов.
Выходные разъемы вживленных датчиков стандартизированы. И расположены на височных и затылочной костях черепной коробки. В частности, это позволило отказаться от системы гироскопической стабилизации, поскольку за ориентацию меха в пространстве также отвечает мозг пилота. Боевой механизм имеет приборную панель аварийного управления, но она позволяет совершать только простейшие операции тестового режима. При этом рекомендуется устанавливать модуль гироскопической стабилизации меха, во избежание падения, вызванного потерей равновесия. Нейронное управление обеспечило разумным также возможность существования так называемой «виртуальной реальности», или «вирта», в которую разумный попадает после подключения к мощному компьютеру через разъемы нейронных сетей и запуска программы-симулятора. Во избежание развития психических отклонений не рекомендуется пребывание в виртуальной реальности свыше 6 средних циклов единовременно. В длительный период времени, по тем же причинам, не рекомендуется пребывание в «вирте» на срок общей суммой свыше 1/10 периода.